Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  199  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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12
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27
20
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
64363355--64363390
17
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1.97
64371779--64371816
20
1.9
20
94
0
67
28
34
18
18
1.95
64371780--64371840
20
3.0
20
83
9
63
29
27
14
27
1.95
64371790--64371836
10
4.6
10
80
15
51
31
27
14
25
1.95
64373198--64373284
14
6.5
13
77
16
65
72
5
8
13
1.26
64373207--64373270
30
2.2
29
82
2
74
73
3
7
15
1.19
64374214--64374255
18
2.3
18
87
0
57
71
4
16
7
1.26
64374283--64374347
33
1.9
34
81
12
80
58
1
30
9
1.39
64375390--64375427
10
3.8
10
83
13
51
28
31
18
21
1.97
64375389--64375426
20
1.9
20
94
0
67
28
34
18
18
1.95
64375390--64375450
20
3.0
20
83
9
63
29
27
14
27
1.95
64375400--64375446
10
4.6
10
80
15
51
31
27
14
25
1.95
64378550--64378602
23
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22
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20
56
9
18
1
69
1.25
64384919--64385065
42
3.4
42
79
5
152
31
23
19
24
1.98
64387890--64387927
10
3.8
10
83
13
51
21
18
31
28
1.97
64387867--64387927
20
3.0
20
83
9
63
27
14
27
29
1.95
64387891--64387928
20
1.9
20
94
0
67
18
18
34
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64390943--64391020
38
2.1
38
100
0
156
37
17
17
26
1.93
64394661--64394757
30
3.2
30
75
2
106
28
15
26
28
1.96
64395127--64395166
20
2.0
20
100
0
80
40
15
0
45
1.46
64403434--64403468
16
2.2
16
89
0
52
51
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2
14
1.57
64404840--64404894
29
1.9
28
88
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29
18
29
23
1.98
64404835--64404920
28
3.0
28
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3
100
27
15
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26
1.96
64407105--64407182
21
3.4
23
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26
2
30
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1.70
64407141--64407207
21
3.1
21
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29
2
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1.73
64411760--64411825
21
3.0
22
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30
4
30
34
1.78
64416672--64416717
10
4.5
10
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5
56
15
23
21
39
1.92
64416662--64416707
20
2.2
21
84
3
58
17
23
21
36
1.94
64416669--64416717
21
2.4
20
89
3
71
14
22
22
40
1.90
64416942--64416970
13
2.2
13
100
0
58
27
0
10
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64425817--64425864
14
3.4
14
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0
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43
6
31
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1.75
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20
2.3
20
84
0
56
23
19
17
39
1.92
64428379--64428451
30
2.5
30
86
6
96
21
20
19
38
1.94
64430042--64430100
11
4.8
12
71
20
50
69
3
8
18
1.28
64430081--64430141
27
2.3
26
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13
70
73
4
16
4
1.18
64431173--64431202
11
2.7
11
94
0
51
80
6
13
0
0.91
64431173--64431279
6
17.7
6
68
8
65
71
3
18
6
1.24
64431176--64431232
17
3.3
17
85
4
78
71
7
15
5
1.25
64431240--64431277
13
2.8
13
82
17
51
73
0
18
7
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64431241--64431291
21
2.4
21
74
6
50
74
1
17
5
1.11
64431294--64431356
33
1.9
33
84
12
85
55
6
25
12
1.60
64433140--64433185
20
2.3
20
84
0
56
23
19
17
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1.92
64433133--64433205
30
2.5
30
86
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21
20
19
38
1.94
64437114--64437289
46
3.8
46
77
12
207
21
21
28
28
1.99
64437110--64437281
93
1.8
93
94
0
308
21
22
29
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1.99
64438347--64438609
45
5.9
45
93
0
438
38
15
19
25
1.91
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1.52
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96
0
474
39
15
19
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1.91
64449040--64449118
15
5.4
15
80
10
92
10
16
13
59
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349