Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  105  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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1.87
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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26
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1
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33015623--33015709
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204
20
23
28
28
1.99
33048686--33048835
41
3.7
41
82
1
203
22
23
26
28
1.99
33052171--33052249
38
2.1
38
100
0
158
37
25
7
29
1.83
33052602--33052634
16
2.1
16
100
0
66
36
27
0
36
1.57
33058534--33058630
28
3.4
28
88
1
113
29
12
24
32
1.92
33058560--33058630
28
2.5
28
95
0
124
32
11
22
33
1.90
33069956--33070126
93
1.8
93
91
0
279
29
27
20
22
1.98
33069951--33070123
46
3.7
46
76
13
183
30
26
20
22
1.98
33078715--33078798
42
2.0
42
97
0
159
16
25
9
48
1.76
33080911--33081025
53
2.1
54
95
1
205
18
23
23
34
1.96
33080911--33081049
27
5.2
26
81
8
154
19
22
23
34
1.96
33080911--33081049
53
2.6
53
89
3
190
19
22
23
34
1.96
33086872--33087012
27
5.2
27
78
13
148
20
24
21
34
1.97
33086869--33087012
54
2.7
54
91
4
220
20
24
21
34
1.97
33088671--33088783
43
2.9
37
74
16
120
46
12
15
25
1.80
33091908--33091941
17
2.0
17
88
11
52
11
26
41
20
1.87
33097990--33098130
48
2.9
48
81
4
140
34
27
16
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33106493--33106682
96
2.0
96
94
0
335
23
14
31
30
1.95
33107197--33107222
13
2.0
13
100
0
52
15
23
38
23
1.92
33111321--33111439
55
2.2
55
83
3
150
26
27
26
20
1.99
33116229--33116350
46
2.6
47
84
5
147
27
22
13
36
1.92
33124425--33124486
28
2.3
27
77
2
70
19
24
25
30
1.98
33126001--33126027
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
33132807--33132991
79
2.3
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84
7
236
24
22
27
25
2.00
33132808--33132991
40
4.6
40
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24
22
27
25
2.00
33132808--33133024
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2.7
79
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7
201
25
22
27
24
2.00
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40
5.7
40
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6
296
24
22
27
25
2.00
33140676--33140899
78
2.8
80
84
8
296
24
22
27
25
2.00
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14
2.1
14
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0
51
20
6
10
63
1.47
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24
3.6
24
83
11
75
67
8
0
23
1.18
33161601--33161639
19
2.0
20
95
5
71
71
10
0
17
1.12
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19
2.2
20
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4
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79
9
0
11
0.95
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35
2.1
35
100
0
144
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16
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1.90
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46
2.7
46
85
8
159
28
19
28
23
1.98
33166100--33166274
49
3.6
49
81
6
205
26
18
29
24
1.98
33173024--33173060
13
2.5
15
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12
51
51
5
0
43
1.24
33173527--33173558
13
2.3
15
89
10
50
40
0
0
59
0.97
33173540--33173588
24
2.0
24
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40
0
4
55
1.19
33175397--33175470
24
3.1
25
74
14
75
25
13
27
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33175408--33175470
24
2.7
23
82
5
81
25
14
26
33
1.94
33176036--33176098
30
2.1
30
96
0
117
26
3
12
57
1.51
33176181--33176219
18
2.2
18
86
9
53
20
0
12
66
1.24
33177754--33177792
15
2.4
17
87
12
55
76
2
12
7
1.09
33180733--33180895
43
3.8
43
79
8
161
22
17
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31
1.97
33182534--33182757
49
4.6
48
80
10
208
28
22
26
23
1.99
33182534--33182757
98
2.3
95
82
8
274
28
22
26
23
1.99
33188402--33188452
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2.7
19
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14
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41
0
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2.5
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9
102
18
17
9
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1.70
33194788--33194862
36
2.2
33
81
13
89
22
12
8
57
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349