Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  30  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8267220--8267461
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2.4
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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0
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3
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2.0
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1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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19
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
8443620--8443672
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0
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0
2
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1.35
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2.6
15
88
4
53
32
5
5
57
1.42
8450069--8450124
23
2.3
26
85
14
75
35
10
0
53
1.36
8451838--8451950
55
2.1
55
100
0
226
32
10
15
40
1.82
8466900--8466983
40
2.1
40
97
2
161
46
17
9
26
1.79
8469897--8469933
9
4.1
9
89
0
56
48
13
8
29
1.71
8471164--8471215
25
2.1
25
92
0
86
30
15
15
38
1.88
8472175--8472205
16
1.9
16
100
0
62
38
6
19
35
1.77
8475197--8475470
46
6.0
46
93
0
415
22
23
14
39
1.91
8476627--8476660
17
2.0
17
94
0
59
47
2
5
44
1.42
8480744--8480809
24
2.7
26
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11
75
31
18
31
18
1.95
8481122--8481163
21
2.0
21
85
0
57
45
21
0
33
1.52
8483502--8483552
18
2.8
19
79
8
61
33
0
1
64
1.05
8483561--8483597
19
2.0
19
89
5
58
37
0
5
56
1.22
8493487--8493526
19
2.1
19
95
0
71
52
15
25
7
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8498763--8498823
13
4.7
13
76
8
54
32
3
24
39
1.72
8508348--8508385
14
2.7
15
88
8
53
52
2
2
42
1.29
8508497--8508536
20
2.0
20
100
0
80
50
0
0
50
1.00
8508492--8508536
20
2.4
18
85
7
54
48
0
0
51
1.00
8509386--8509437
15
3.2
15
73
19
50
44
0
1
53
1.11
8509466--8509511
13
3.5
13
82
14
58
52
2
0
45
1.13
8509514--8509553
20
2.0
20
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0
62
55
0
0
45
0.99
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29
4.3
33
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24
91
53
0
0
46
1.05
8509526--8509575
16
3.3
15
75
16
50
52
0
2
46
1.12
8511571--8511600
14
2.2
13
94
5
51
23
0
26
50
1.50
8512586--8512619
15
2.3
15
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10
52
52
17
5
23
1.66
8516798--8516836
20
2.1
18
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9
51
56
2
0
41
1.13
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31
1.9
30
89
3
91
32
1
0
66
1.02
8518435--8518511
21
3.7
21
77
6
59
29
27
27
15
1.96
8521321--8521375
25
2.2
26
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9
69
58
7
9
25
1.55
8530754--8530804
20
2.5
20
96
0
93
15
31
31
21
1.95
8533649--8533709
23
2.6
24
80
15
65
47
0
4
47
1.23
8537141--8537173
11
2.7
13
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18
52
6
30
9
54
1.56
8537231--8537332
50
2.0
50
100
0
204
31
35
11
21
1.90
8538552--8538598
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
8538869--8539159
46
6.5
46
86
7
393
22
24
14
38
1.92
8539038--8539197
38
4.0
38
86
12
230
25
25
16
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8538993--8539208
84
2.6
84
98
0
414
25
24
15
34
1.95
8543192--8543246
11
5.3
11
78
10
53
52
7
5
34
1.52
8543192--8543244
20
2.5
21
84
9
72
52
7
5
33
1.53
8543295--8543435
26
6.1
23
68
21
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55
4
6
34
1.45
8543292--8543462
68
2.5
70
75
16
164
56
4
5
33
1.41
8543361--8543464
37
2.6
39
76
15
99
60
3
1
33
1.26
8543418--8543468
15
3.5
15
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2
59
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1
0
35
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8543941--8544018
29
2.7
29
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13
70
56
7
1
34
1.36
8543869--8544143
128
2.1
129
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321
59
5
4
30
1.38
8544219--8544293
3
25.3
3
87
2
107
64
1
1
33
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349