Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  349  ( 41854 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7097542--7097634
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125
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20
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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30
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42
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79
25
2
0
71
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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29
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0
116
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31
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7326789--7326842
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51
3
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1.48
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0
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56
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5
16
43
1.71
7337482--7337534
24
2.2
24
89
0
79
39
1
9
49
1.46
7342550--7342609
22
2.9
21
80
11
70
66
3
1
28
1.17
7342550--7342603
21
2.5
22
85
8
67
64
3
1
29
1.21
7347306--7347335
9
3.2
9
95
4
51
23
13
10
53
1.69
7348334--7348411
39
2.0
39
92
0
129
51
12
20
15
1.76
7348752--7348776
12
2.1
12
100
0
50
60
0
0
40
0.97
7349004--7349209
103
2.0
103
99
0
403
39
12
12
35
1.81
7359514--7359552
13
2.8
14
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11
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51
0
0
48
1.00
7359564--7359601
19
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20
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7
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1.15
7365610--7365646
12
3.1
12
88
0
56
59
2
21
16
1.49
7373058--7373094
19
1.9
19
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0
65
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5
0
27
1.12
7378749--7378795
18
2.8
16
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12
58
68
4
0
27
1.08
7379740--7379785
19
2.4
20
75
20
53
45
4
2
47
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7379821--7379895
18
3.9
18
74
19
62
34
5
4
56
1.41
7379821--7379906
20
4.3
20
72
19
65
36
4
3
55
1.37
7380032--7380061
14
2.1
15
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6
53
40
0
0
60
0.97
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27
1.9
27
85
14
72
34
5
25
34
1.80
7382834--7382908
27
2.7
27
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14
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33
5
24
37
1.78
7384744--7384785
22
2.0
21
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4
0
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1.17
7388180--7388298
3
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3
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14
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26
5
5
62
1.41
7388351--7388438
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2.9
30
100
0
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10
6
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44
3.5
44
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11
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13
20
32
1.92
7392747--7392903
51
3.2
51
78
12
202
33
12
21
32
1.91
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2.6
23
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10
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13
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11
2.3
11
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0
50
28
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24
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1.83
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23
2.0
23
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45
10
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23
2.0
23
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8
56
40
13
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1.76
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23
2.0
23
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1.65
7412571--7412615
23
2.0
23
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8
56
40
13
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1.76
7414331--7414374
21
2.1
21
91
0
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25
15
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47
1.79
7419049--7419341
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3.4
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7
263
27
21
24
26
1.99
7419094--7419385
44
6.7
45
71
9
174
28
20
24
25
1.99
7419001--7419452
175
2.6
175
87
1
627
29
21
23
25
1.99
7421091--7421203
3
37.3
3
71
11
79
25
4
5
64
1.33
7421072--7421149
36
2.2
36
83
4
95
26
3
6
62
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7423415--7423445
14
2.2
14
100
0
62
35
6
6
51
1.53
7425422--7425446
2
12.5
2
100
0
50
0
0
48
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1.00
7438214--7438255
16
2.4
17
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15
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2
11
14
1.24
7442916--7442962
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12
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4
2
40
1.32
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4.2
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100
0
50
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0
0
16
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2
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3
60
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0
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1.11
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2.0
15
100
0
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0
0
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43
0
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1.29
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19
2.0
21
85
10
55
25
5
7
61
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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