Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  25  of  349  ( 41854 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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26
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100
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12
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
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7
6.7
7
76
4
51
22
0
27
50
1.50
7018487--7018539
15
3.6
15
76
2
54
16
5
45
32
1.71
7018680--7018724
14
3.2
14
87
0
63
22
0
31
46
1.52
7018964--7019083
59
2.0
59
100
0
240
45
13
6
34
1.69
7019208--7019286
7
11.0
7
86
5
68
59
1
1
37
1.14
7023070--7023094
10
2.5
10
100
0
50
36
8
0
56
1.29
7023821--7023856
16
2.3
16
90
4
56
52
11
13
22
1.72
7024183--7024288
53
2.0
53
100
0
212
45
15
9
30
1.77
7025160--7025212
28
1.9
27
85
11
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60
0
1
37
1.08
7025160--7025212
27
1.9
28
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3
81
60
0
1
37
1.08
7025178--7025258
36
2.2
36
84
4
110
62
2
3
30
1.25
7025429--7025543
55
2.1
56
83
8
146
35
5
2
56
1.36
7025496--7025559
27
2.3
27
91
5
101
43
3
1
51
1.26
7025550--7025669
9
13.3
9
68
15
52
31
3
0
64
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7027755--7027798
22
2.0
22
90
0
70
18
13
22
45
1.84
7030040--7030198
27
5.9
27
82
11
184
33
21
25
19
1.97
7030058--7030201
54
2.7
54
94
2
245
34
22
25
18
1.96
7034821--7034851
16
1.9
16
93
0
53
51
0
9
38
1.35
7034817--7034881
28
2.3
27
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10
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40
0
10
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1.38
7035809--7035841
12
2.8
12
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0
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24
12
0
63
1.28
7037931--7037959
11
2.5
12
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5
51
20
6
0
72
1.07
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3
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3
100
0
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0
0
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24
3.1
24
100
0
148
44
8
12
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1.71
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19
2.1
19
100
0
78
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0
35
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1.58
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1.9
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2
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45
6
0
47
1.29
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2.1
38
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6
90
51
5
1
42
1.31
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18
3.9
18
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0
131
34
12
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1.92
7067409--7067437
12
2.4
12
100
0
58
34
0
17
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1.47
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21
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36
4
0
60
1.16
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2.5
88
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2
295
58
12
4
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1.53
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8
3.1
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0
50
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0
24
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74
2.0
74
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0
236
48
6
5
39
1.51
7079067--7079095
14
2.1
14
100
0
58
31
20
20
27
1.98
7087391--7087550
41
3.9
41
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2
187
28
16
25
29
1.97
7093547--7093580
17
1.9
18
88
5
52
47
5
14
32
1.69
7095006--7095073
16
4.2
16
94
0
109
29
0
35
35
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7095054--7095151
45
2.2
44
85
1
133
36
5
26
31
1.78
7095310--7095344
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
7095268--7095340
27
2.7
27
76
8
76
52
2
0
45
1.15
7095229--7095503
147
1.9
149
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1
509
46
3
2
47
1.33
7095457--7095491
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
7095477--7095655
55
3.1
54
64
22
128
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2
41
1.43
7095577--7095611
18
2.0
17
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60
0
0
40
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0
0
53
1.00
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5
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1.36
7097488--7097534
19
2.4
19
96
3
85
44
21
4
29
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349