Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  123  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Copy
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.00
39368984--39369046
22
2.9
22
76
9
58
38
28
3
30
1.73
39371397--39371477
32
2.6
30
84
7
99
34
12
8
44
1.73
39384354--39385145
95
8.4
95
84
1
908
38
13
18
29
1.89
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47
2.8
47
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0
179
31
27
16
23
1.96
39407650--39407681
9
3.7
9
95
4
57
50
0
31
18
1.48
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45
2.8
45
86
0
169
38
15
24
22
1.92
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75
2.2
75
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2
212
23
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33
1.88
39420105--39420136
9
3.7
9
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4
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50
0
31
18
1.48
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45
2.8
45
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0
160
39
15
23
22
1.92
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75
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2
212
23
10
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33
1.88
39428680--39428712
15
2.1
16
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1.24
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1.91
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28
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0
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29
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1.91
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21
1.9
22
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5
57
31
21
4
41
1.74
39449874--39449952
28
2.8
28
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0
122
27
26
12
32
1.93
39449874--39449980
57
1.9
57
82
1
135
28
28
13
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
50
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22
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22
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61
2
2
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17
2.2
16
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10
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60
0
0
40
0.97
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25
2.4
25
86
10
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41
1
0
56
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0
3
35
1.15
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2.0
78
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0
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1
3
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1.17
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0
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0
0
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2
2
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2.0
116
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0
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4.3
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33
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12
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0
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0
1.54
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2.0
31
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0
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14
1.92
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2.0
33
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0
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1.84
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46
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20
1.89
39498578--39498807
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2.5
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2
327
41
15
22
20
1.89
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20
2.7
20
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0
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1.74
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2.0
75
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0
275
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15
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3.2
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19
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34
1.84
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19
4.2
19
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9
117
35
16
8
39
1.80
39508647--39508725
36
2.1
39
88
9
119
35
16
8
39
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39508906--39509038
29
4.6
29
85
2
162
33
21
6
39
1.79
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2.7
23
95
2
110
56
31
0
12
1.37
39509140--39509211
23
3.1
23
89
2
81
58
27
0
13
1.36
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14
2.3
15
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5
59
57
18
0
24
1.40
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37
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0
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25
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48
98
0
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29
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29
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1.95
39517556--39517688
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40
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367
25
31
22
19
1.98
39517734--39517800
23
3.2
23
64
24
65
25
26
22
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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