Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  201  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65087966--65088012
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1.95
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0
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85
0
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1.99
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1.99
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34
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106
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65156897--65156976
29
2.9
28
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5
81
25
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15
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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19
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28
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3.5
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65195474--65195528
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2.2
26
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3
16
1
78
0.98
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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29
29
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1.96
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5.5
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0
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21
23
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65261376--65261431
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11
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13
1.13
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0
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2.7
12
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0
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0
21
18
1.38
65269223--65269308
28
3.0
27
81
9
100
30
12
12
44
1.80
65269225--65269308
29
2.9
28
84
8
107
30
13
13
42
1.82
65272399--65272455
11
5.5
10
73
22
55
77
1
17
3
1.00
65272388--65272455
21
3.2
20
80
12
66
76
2
17
2
1.04
65272399--65272455
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
65272399--65272455
16
3.7
14
80
17
60
77
1
17
3
1.00
65272503--65272533
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
65272536--65272617
30
2.7
31
81
5
96
65
1
21
10
1.30
65272541--65272610
24
2.9
24
74
6
61
62
1
24
11
1.36
65274738--65274825
30
2.9
30
75
0
104
27
28
17
27
1.97
65277528--65277624
30
3.2
30
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8
90
27
15
28
27
1.96
65279734--65279813
30
2.6
31
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13
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13
22
1
62
1.38
65279898--65279952
6
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6
75
20
53
0
20
1
78
0.85
65279887--65279930
15
2.9
15
93
3
70
2
15
0
81
0.78
65279887--65279948
21
2.7
23
80
16
76
1
17
1
79
0.90
65281741--65281786
20
2.2
21
88
3
67
19
23
19
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65282010--65282038
13
2.2
13
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0
58
27
0
10
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1.28
65284292--65284335
22
2.0
23
90
4
72
40
31
4
22
1.74
65284298--65284360
21
3.0
21
83
2
63
36
31
3
28
1.73
65284154--65284585
215
2.0
215
100
0
864
28
25
11
34
1.91
65284507--65284550
22
2.0
23
90
4
72
40
31
4
22
1.74
65284513--65284575
21
3.0
21
83
2
63
36
31
3
28
1.73
65286660--65286706
20
2.3
20
85
0
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21
12
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1.91
65287608--65287632
11
2.3
11
100
0
50
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0
8
48
1.32
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25
2.4
24
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2
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79
3
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10
1.04
65292338--65292395
12
4.8
12
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4
89
79
3
6
10
1.04
65298369--65298423
15
3.8
15
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2
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1
21
1
74
1.01
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2.4
18
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7
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57
4
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14
1.56
65307283--65307384
30
3.4
29
72
7
98
31
15
25
27
1.96
65309564--65309594
12
2.6
12
100
0
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25
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12
45
1.83
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6
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16
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2
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2
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65309644--65309714
37
1.9
37
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101
2
18
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76
1.04
65309640--65309700
16
3.8
16
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3
19
1
75
1.03
65312391--65312487
30
3.2
30
72
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28
16
26
27
1.97
65325869--65325965
40
2.4
40
91
3
151
23
20
27
27
1.99
65330446--65330478
12
2.7
12
95
4
57
78
0
9
12
0.95
65331268--65331301
15
2.3
15
89
0
50
35
29
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2
1.73
65335503--65335535
12
2.8
12
86
4
50
36
0
9
54
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65340340--65340374
18
1.9
18
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11
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20
0
57
1.41
65341249--65341315
14
4.6
15
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15
52
5
14
5
73
1.23
65343435--65343537
30
3.4
29
73
6
98
26
26
16
31
1.97
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17
2.0
18
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10
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22
0
2
75
0.94
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18
2.2
18
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0
51
61
2
23
12
1.43
65348566--65348661
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3.2
30
68
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79
27
15
30
27
1.96
65348991--65349030
19
2.1
19
85
0
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25
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1.95
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14
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0
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1.75
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10
100
0
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1.85
65352478--65352511
13
2.8
12
91
8
52
70
5
8
14
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349