Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  334  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110757439--110757520
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2.3
36
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0
101
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0
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2.0
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21
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110787102--110787162
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0
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0
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26
1.78
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7.2
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12
78
44
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22
25
1.79
110811156--110811279
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0
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2
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88
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51
58
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225
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23
1.95
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108
2.3
110
79
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293
35
16
24
23
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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2.0
20
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22
0
40
1.54
110832846--110833061
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4.0
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6
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25
16
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1.95
110832846--110833054
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1.9
109
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2
314
23
25
16
34
1.95
110839746--110839912
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2.8
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83
9
194
42
1
3
52
1.26
110839746--110839912
60
2.8
57
79
14
160
42
1
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110847254--110847423
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2.0
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0
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49
21
1
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2.0
219
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0
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1.00
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1.9
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0
243
41
6
13
38
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
223
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2.0
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1.80
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3.5
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10
25
33
1.90
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21
2.8
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61
0
8
29
1.26
110902291--110902345
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2.5
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61
0
9
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2.0
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26
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64
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6
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1.24
110909032--110909091
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56
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1.90
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0
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1.70
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25
1.99
110949069--110949124
25
2.3
24
81
3
58
10
12
3
73
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110954262--110954291
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2.1
14
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0
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1.47
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45
2.2
45
92
0
164
19
21
20
40
1.92
110956461--110956595
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159
20
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1.9
18
88
0
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20
14
14
51
1.76
110956728--110956776
18
2.7
18
90
0
71
32
12
18
36
1.88
110960208--110960268
6
10.2
6
75
7
52
45
1
32
19
1.60
110964032--110964071
20
2.0
20
95
0
71
47
10
22
20
1.79
110967061--110967092
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
110967062--110967092
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
110970614--110970671
30
1.9
30
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0
89
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3
24
31
1.71
110970883--110970914
13
2.5
13
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0
55
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0
12
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50
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0
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20
1.98
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30
1.9
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0
89
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1.71
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13
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0
55
31
0
12
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1.37
110978539--110978785
50
4.8
50
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284
25
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1.99
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19
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0
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111017728--111017782
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13
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49
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1.74
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2.5
30
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42
1.48
111028341--111028491
60
2.5
60
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1
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50
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13
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1.76
111028466--111028531
30
2.2
31
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2
98
48
9
15
27
1.74
111031099--111031141
12
3.6
12
83
0
50
32
11
0
55
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111031212--111031279
29
2.3
29
78
14
77
35
1
11
51
1.48
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20
2.0
20
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0
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28
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0
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13
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29
0
0
70
0.88
111033103--111033140
11
3.2
12
85
7
51
31
0
0
68
0.90
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0
5
47
1.24
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2.0
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58
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0
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18
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0
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1.25
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2
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29
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115
10
10
1
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1.02
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17
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1.00
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2.7
26
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2
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9
7.9
9
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7
74
12
4
2
80
0.96
111038804--111038876
35
2.1
33
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10
5
2
80
0.97
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28
4.2
28
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15
85
37
2
7
52
1.43
111039399--111039449
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18
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1
0
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44
0
0
55
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28
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29
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2
117
53
4
0
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1.22
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1.9
22
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75
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6
11
1.20
111039810--111039881
9
8.4
8
76
8
54
77
4
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11
1.09
111039896--111039965
22
3.1
22
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10
54
77
1
8
12
1.06
111039909--111039965
17
3.8
17
65
29
56
77
1
8
12
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111039902--111039967
27
2.4
28
89
7
107
77
1
9
12
1.06
111039936--111039977
17
2.5
17
80
3
50
76
4
11
7
1.15
111041379--111041447
20
3.6
18
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53
10
2
33
1.49
111041382--111041428
19
2.4
20
85
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53
10
2
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14
100
0
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0
0
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1.66
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6
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20
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127
18
26
21
33
1.96
111063821--111063880
25
2.4
25
86
8
77
25
20
20
35
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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