Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  49  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Number
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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25
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30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14176970--14177029
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23
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23
2.2
25
82
6
63
71
0
26
1
0.97
14198452--14198501
21
2.4
21
90
6
75
12
8
36
44
1.71
14200675--14201246
186
3.1
185
87
2
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45
17
10
27
1.81
14206173--14206527
47
7.6
45
73
10
243
27
21
28
22
1.99
14206182--14206527
94
3.7
92
78
11
346
28
20
28
22
1.99
14214148--14214180
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
14221913--14221979
11
5.6
11
71
22
55
17
4
1
76
1.04
14221896--14221979
17
4.9
17
77
8
73
16
5
1
76
1.05
14221913--14221959
6
8.0
6
83
4
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14
4
2
78
0.99
14224877--14224909
13
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13
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39
0
12
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1.40
14234534--14234568
17
2.0
18
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0
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11
1.00
14234534--14234567
8
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8
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76
0
11
11
1.02
14235837--14235972
43
3.1
44
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5
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29
27
20
22
1.98
14235874--14235972
43
2.3
43
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0
180
28
29
20
22
1.98
14236066--14236206
47
3.0
47
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0
228
49
24
7
19
1.72
14236409--14236448
21
1.9
21
90
10
64
17
27
17
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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4
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64
5
3
25
1.33
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543
2.0
543
93
1
1822
42
15
14
27
1.86
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12
2.1
12
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0
50
60
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16
1.58
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15
2.1
15
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0
55
28
6
0
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0
180
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1.81
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26
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0
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1.84
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19
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2
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1.50
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0
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0
0
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2.5
107
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1
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22
30
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2.4
21
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19
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18
20
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18
1.89
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3.5
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0
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23
18
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54
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2
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0
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2.2
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68
0
2
28
1.03
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19
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2.3
19
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4
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20
0
6
72
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14310665--14310713
24
2.0
24
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28
0
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0
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1.81
14321385--14321485
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26
93
0
175
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2
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0
0
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7.1
7
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0
0
36
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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