Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  311  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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12
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12
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51
32
1
0
65
1.02
104101419--104101483
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30
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1
0
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1.01
104101420--104101476
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18
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1
0
64
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104141092--104141182
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104141106--104141161
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104143127--104143171
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2.0
22
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8
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2
4
57
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
132
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104165659--104165705
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4.8
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30
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174
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2.3
29
82
5
84
27
29
13
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104201709--104201777
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2.3
30
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27
28
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28
1.95
104201424--104201926
175
2.9
174
97
0
952
30
24
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1.95
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2.7
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110
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46
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23
22
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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