Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  70  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20665511--20665578
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24
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0
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18
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47
13
0
38
1.49
20665916--20666139
71
3.1
71
77
9
182
47
12
0
38
1.48
20665943--20666161
113
1.9
112
86
4
307
47
13
0
38
1.49
20665943--20666168
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37
73
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47
13
0
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0
0
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0
0
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18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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3.1
26
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2
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0
0
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2.0
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4
0
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19
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18
4.3
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62
39
10
15
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1.82
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1
0
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0
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1.02
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15
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23
1.95
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1.99
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3.7
46
80
5
179
27
19
28
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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3.0
24
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15
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1.95
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25
2.0
25
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2.0
64
100
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19
30
1.94
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1.98
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12
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25
29
18
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1.98
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29
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1.98
20818446--20818500
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26
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0
1
52
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20818638--20818732
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45
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16
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0
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0
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18
28
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20
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20
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0
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14
14
14
1.66
20836456--20836496
11
3.7
11
86
0
64
34
17
19
29
1.94
20851295--20851340
23
2.0
23
91
0
74
63
6
13
17
1.50
20852833--20852878
19
2.5
19
96
3
85
65
13
2
19
1.37
20857125--20857169
19
2.4
19
85
7
56
68
0
28
2
1.01
20861158--20861353
25
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25
91
1
313
22
26
19
31
1.98
20861345--20861412
22
3.1
21
78
4
73
16
20
17
45
1.85
20865972--20866143
18
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18
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0
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20865972--20866165
36
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36
78
0
183
37
12
15
34
1.86
20865972--20866143
54
3.2
54
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1
274
38
11
15
34
1.84
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0
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1.88
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9
2.8
9
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0
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0
0
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1.85
20884423--20884582
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76
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8
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5
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5
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0
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0
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12
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0
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29
7
0
62
1.22
20902182--20902251
36
1.9
36
97
0
131
42
24
7
25
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20902378--20902440
23
2.7
24
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4
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50
15
19
14
1.77
20904832--20904927
48
2.0
47
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2
174
31
4
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50
1.62
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50
3.5
50
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2
248
35
15
21
27
1.94
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31
5.5
31
88
0
261
29
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26
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7
4.1
7
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0
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13
1.82
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2.7
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15
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29
1.96
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0
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13
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0
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12
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17
0
2
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0.84
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40
20
24
14
1.90
20957055--20957132
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4.3
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1.22
20960026--20960069
22
2.0
22
95
0
79
34
18
27
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20964474--20964588
38
3.0
38
100
0
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3.0
46
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137
26
15
29
28
1.96
20982556--20982586
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2.8
11
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0
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0
0
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0.91
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1
7
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44
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20985608--20986139
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139
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20
17
33
1.95
20985331--20986139
229
3.5
226
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670
28
20
17
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18
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2.4
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244
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22
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1.97
20986441--20986509
34
2.0
34
97
0
129
39
23
17
20
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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