Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  266  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89005233--89005439
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22
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1.99
89006462--89006597
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224
28
22
22
26
1.99
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27
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.98
89073430--89073657
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2.7
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2
325
25
31
20
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1.98
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40
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22
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27
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1.9
28
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6.6
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205
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28
29
1.96
89109208--89109363
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1.9
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233
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15
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1.96
89109204--89109384
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2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
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1.78
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2.0
108
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1.77
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54
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54
92
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349
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20
5
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1.76
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80
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6
30
1.79
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10.7
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220
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1.80
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27
8.1
27
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257
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1.94
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174
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1.94
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38
1.84
89167684--89167987
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3.7
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88
1
428
30
22
7
39
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89168224--89168275
27
2.0
26
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3
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17
26
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1.95
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2.1
68
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2
201
17
27
22
31
1.97
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21
23
20
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1.96
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19
12
46
1.82
89168490--89168630
6
22.8
6
68
16
74
21
19
12
46
1.82
89168490--89168616
56
2.3
56
97
0
236
21
20
11
46
1.82
89168521--89168612
25
3.4
25
78
16
112
21
22
9
45
1.81
89174037--89174277
25
9.6
25
88
0
349
25
17
12
45
1.82
89174037--89174277
50
4.8
50
92
0
392
25
17
12
45
1.82
89174198--89174261
12
5.2
12
70
7
56
23
15
12
48
1.79
89176103--89176265
74
2.2
74
91
1
263
26
16
9
47
1.78
89176103--89176265
25
6.6
25
89
1
247
26
16
9
47
1.78
89178095--89178258
25
6.6
25
91
0
256
26
17
9
46
1.78
89178106--89178244
12
11.2
12
66
7
71
26
15
10
47
1.77
89180088--89180251
25
6.6
25
91
0
256
26
17
9
46
1.78
89180099--89180237
12
11.2
12
66
7
71
26
15
10
47
1.77
89182081--89182244
25
6.6
25
91
0
256
26
17
9
46
1.78
89182092--89182230
12
11.2
12
66
7
71
26
15
10
47
1.77
89184073--89184236
25
6.6
25
91
0
256
26
17
9
46
1.78
89184084--89184222
12
11.2
12
66
7
71
26
15
10
47
1.77
89186064--89186252
25
7.6
25
88
0
270
26
16
9
47
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89187082--89187212
45
2.9
43
83
7
145
25
23
22
28
1.99
89191976--89192199
40
5.6
39
86
4
272
24
21
28
25
1.99
89191976--89192199
79
2.8
79
85
5
292
24
21
28
25
1.99
89191976--89192232
79
3.3
79
83
7
238
25
21
28
24
1.99
89199381--89199571
50
3.9
49
87
5
262
28
13
10
47
1.75
89199385--89199571
25
7.6
25
84
3
236
28
13
10
47
1.75
89200408--89200627
45
5.0
45
92
2
349
23
21
27
27
1.99
89201949--89201978
16
1.9
15
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33
23
0
43
1.54
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27
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29
28
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26
1.96
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1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
89211637--89211669
4
8.5
4
86
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45
0
3
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1.16
89211796--89211828
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1.9
17
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0
57
42
0
12
45
1.41
89215077--89215118
20
2.0
22
90
9
70
52
0
0
47
1.00
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2.2
29
88
2
94
35
3
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52
1.49
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3.5
45
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166
22
19
28
29
1.98
89222190--89222277
30
3.0
30
80
8
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11
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14
57
1.64
89222199--89222278
15
5.4
15
79
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83
11
16
12
60
1.60
89226268--89226487
46
4.7
46
75
11
148
24
29
19
27
1.98
89228624--89228708
22
4.0
20
68
18
55
60
2
1
36
1.18
89228653--89228708
16
3.4
16
75
12
51
64
1
0
33
1.04
89228636--89228709
28
2.5
28
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60
1
1
36
1.13
89230260--89230300
21
2.0
21
85
9
57
39
9
7
43
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89234238--89234293
27
2.1
27
89
0
85
37
17
16
28
1.91
89234408--89234441
17
1.9
18
94
5
61
11
41
32
14
1.82
89240510--89240602
42
2.2
42
84
3
116
33
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11
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1.92
89243666--89243701
16
2.2
16
95
0
63
36
16
25
22
1.94
89247170--89247278
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1.9
57
94
0
191
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18
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1.76
89250425--89250578
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3.7
42
76
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159
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23
14
31
1.94
89250425--89250577
84
1.8
84
82
1
191
31
23
14
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0
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40
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277
26
28
22
23
1.99
89255693--89255875
79
2.3
80
89
0
269
26
27
22
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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