Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  88  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26446820--26447044
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79
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2.3
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184
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2.0
66
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0
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2.0
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22
4
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26490381--26490495
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0
0
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77
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10
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0
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0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26503973--26504006
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52
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0
0
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35
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0
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1
0
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4.1
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80
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1.88
26534291--26534390
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4.3
23
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105
39
29
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20
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2.4
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27
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2.0
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1.91
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2.6
35
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3
119
26
14
16
42
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
28
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0
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20
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1.94
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13
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1.83
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17
2.0
17
88
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50
51
9
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33
1.58
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4.6
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22
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1.98
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46
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130
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22
22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26583497--26583722
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4.5
50
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0
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27
13
29
1.94
26587339--26587468
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27
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25
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0
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30
18
25
26
1.98
26591016--26591096
25
3.2
25
81
10
78
29
17
25
27
1.97
26593249--26593365
38
3.1
38
81
2
137
25
36
12
24
1.91
26596724--26596763
21
1.9
21
85
10
55
37
5
7
50
1.53
26598092--26598157
26
2.6
26
72
15
66
33
0
1
65
1.02
26598133--26598168
17
2.1
17
89
5
54
33
0
2
63
1.08
26602789--26602881
44
2.1
44
93
0
159
34
22
17
25
1.96
26607014--26607062
20
2.5
20
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6
64
67
2
30
0
1.02
26608249--26608339
36
2.5
36
75
16
107
37
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14
36
1.83
26608224--26608339
18
6.5
18
70
12
71
36
12
15
36
1.85
26614168--26614210
17
2.5
17
100
0
86
16
23
41
18
1.89
26615158--26615183
13
2.0
13
100
0
52
30
15
23
30
1.95
26617109--26617220
18
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17
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89
33
13
16
35
1.88
26617109--26617220
36
3.1
35
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5
134
33
13
16
35
1.88
26618026--26618703
339
2.0
339
94
1
1198
31
13
23
32
1.93
26625845--26625931
30
2.8
32
73
16
94
60
1
4
33
1.24
26631469--26631603
40
3.4
40
94
2
236
21
20
27
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26638714--26638847
40
3.4
40
92
2
225
20
20
28
31
1.97
26645533--26645687
79
2.0
79
84
1
204
44
10
12
32
1.76
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203
2.0
203
87
0
580
30
19
21
28
1.98
26655065--26655097
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
26655220--26655280
30
2.0
30
90
6
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57
11
3
27
1.49
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11
3.7
11
80
0
55
56
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14
19
1.66
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43
4.5
43
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1
302
31
14
20
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1.92
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91
2.0
91
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0
340
41
7
12
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1.70
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10
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1.85
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7
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39
18
10
32
1.85
26669447--26669910
81
5.6
81
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39
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10
32
1.84
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1.9
170
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40
18
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30
1.83
26671454--26671483
15
2.0
15
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0
51
20
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1.78
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19
26
1.98
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27
17.2
26
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5
289
39
18
9
31
1.84
26674829--26675290
54
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364
39
18
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31
1.84
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5.6
81
78
5
321
39
17
9
32
1.83
26675244--26675308
27
2.4
27
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43
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10
29
1.82
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8
4.2
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13
54
63
0
0
36
0.94
26699059--26699094
18
2.1
16
90
10
54
63
0
0
36
0.94
26707821--26707997
46
3.8
46
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12
191
22
20
28
29
1.98
26707819--26707988
93
1.8
93
93
0
295
22
21
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26709506--26709551
22
2.1
22
95
0
83
23
28
13
34
1.92
26713320--26713443
26
4.7
26
78
8
108
41
20
8
28
1.82
26713428--26713649
27
8.2
27
85
2
302
37
17
18
26
1.93
26713686--26713724
20
2.0
20
89
0
60
12
15
30
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1.85
26713750--26713808
22
2.7
22
83
0
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20
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22
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1.97
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55
0
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1.31
26718424--26718472
24
2.0
25
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59
0
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19
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0
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0
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135
30
23
12
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1.92
26747626--26747739
39
2.9
39
81
0
138
27
28
18
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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