Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  198  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64090177--64090218
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.4
24
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26
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1.99
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5
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2.1
20
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12
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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17
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1.00
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19
1
77
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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27
2.5
28
81
9
72
49
11
8
30
1.69
64155178--64155226
20
2.5
19
83
9
62
38
20
16
24
1.92
64164731--64164782
23
2.3
22
75
21
54
9
23
1
65
1.32
64164740--64164794
12
4.6
12
73
15
51
12
23
0
63
1.29
64164776--64164813
17
2.2
18
85
4
51
10
23
2
63
1.39
64168177--64168201
12
2.1
12
100
0
50
76
8
0
16
1.02
64168195--64168247
23
2.3
23
83
0
61
75
3
11
9
1.16
64168195--64168247
26
2.2
23
83
10
61
75
3
11
9
1.16
64169265--64169372
6
17.7
6
69
10
67
72
3
17
6
1.21
64169333--64169370
13
2.8
13
82
17
51
73
0
18
7
1.06
64169376--64169407
12
2.7
12
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0
55
59
0
21
18
1.38
64173165--64173202
6
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6
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11
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15
0
0
84
0.63
64178053--64178150
30
3.3
30
75
0
88
30
16
25
27
1.96
64178741--64178837
30
3.2
30
73
2
88
29
27
13
28
1.94
64180241--64180268
4
7.0
4
100
0
56
75
0
0
25
0.81
64181621--64181673
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64184008--64184035
4
7.0
4
100
0
56
75
0
0
25
0.81
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11
5.5
10
73
22
55
77
1
17
3
1.00
64186119--64186175
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
64186119--64186175
16
3.7
14
80
17
60
77
1
17
3
1.00
64186244--64186268
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
64186238--64186293
18
3.1
18
76
5
51
69
3
19
7
1.27
64186244--64186325
30
2.7
31
81
5
105
64
1
21
12
1.33
64188426--64188522
30
3.2
31
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5
101
27
28
15
27
1.96
64190433--64190486
20
2.7
20
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0
63
24
20
18
37
1.94
64190433--64190506
30
2.5
30
86
8
98
21
20
18
39
1.93
64190433--64190497
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
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19
2.9
19
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10
60
78
3
7
10
1.06
64192102--64192158
20
2.9
20
71
12
55
78
3
7
10
1.05
64193223--64193326
18
5.6
18
75
5
82
71
3
18
6
1.24
64193219--64193326
6
17.7
6
70
6
74
71
3
18
6
1.23
64193287--64193324
13
2.8
13
82
17
51
73
0
18
7
1.06
64193288--64193338
21
2.4
21
74
6
50
74
1
17
5
1.11
64193341--64193403
33
1.9
33
84
12
85
53
6
26
12
1.62
64195191--64195229
21
2.0
20
90
10
62
23
15
28
33
1.95
64196745--64196791
20
2.3
20
81
0
58
23
12
34
29
1.92
64198457--64198562
48
2.2
48
85
9
137
14
24
1
59
1.45
64199590--64199629
10
3.8
10
83
9
53
2
10
2
85
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64199581--64199644
21
2.7
24
79
18
71
4
17
3
75
1.11
64199581--64199644
24
2.7
24
77
18
62
4
17
3
75
1.11
64201161--64201207
20
2.3
20
81
0
58
23
12
34
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1.92
64203625--64203673
24
2.0
24
96
0
89
46
16
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32
1.65
64218890--64218919
7
4.1
7
95
4
51
83
0
0
16
0.65
64220258--64220310
23
2.4
22
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20
56
9
18
1
69
1.25
64222664--64222692
14
2.0
15
93
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51
82
0
0
17
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2.0
24
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31
4
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1.65
64243739--64243805
21
3.1
21
82
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71
34
32
2
29
1.73
64244104--64244149
13
3.7
12
88
8
65
76
2
8
13
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349