Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  349  ( 41854 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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446
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1.93
Indices
Period
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Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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19
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1
3
72
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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2.3
29
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93
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47
1
19
1.58
8788415--8788487
33
2.2
33
97
2
139
24
9
8
57
1.58
8789027--8789322
125
2.4
125
85
3
407
27
14
19
39
1.90
8789053--8789370
125
2.5
126
81
5
351
28
15
17
38
1.90
8795609--8795870
84
3.1
83
80
11
289
35
19
23
21
1.96
8795745--8795888
44
3.3
44
69
9
132
34
18
24
22
1.97
8795612--8795915
87
3.5
87
80
9
345
34
19
24
22
1.96
8796206--8796251
24
1.9
24
95
0
83
26
50
2
21
1.60
8796230--8796268
17
2.3
17
90
0
60
28
48
0
23
1.51
8796600--8796660
24
2.7
22
78
12
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29
9
1
59
1.39
8797494--8797796
125
2.4
125
88
0
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26
14
19
39
1.90
8797494--8797837
125
2.7
125
83
4
433
27
15
18
38
1.91
8798277--8798326
26
1.9
26
91
0
82
40
2
14
44
1.56
8806176--8806219
21
2.1
21
100
0
88
34
13
27
25
1.93
8810519--8810632
56
2.0
58
84
3
151
46
5
20
28
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8815420--8815462
3
14.3
3
90
9
70
65
0
34
0
0.93
8820683--8820741
29
2.0
29
100
0
118
47
10
13
28
1.75
8820906--8820956
22
2.2
23
89
10
77
19
3
5
70
1.24
8822352--8822383
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
8822352--8822382
9
3.3
9
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8
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19
0
0
80
0.71
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5
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5
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6
67
18
0
0
81
0.70
8833725--8833773
20
2.5
20
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0
80
28
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20
26
1.99
8834625--8834667
16
2.7
16
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37
9
0
53
1.33
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34
2.0
34
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0
125
44
5
11
37
1.66
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30
2.1
30
85
8
85
46
4
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1.49
8851243--8851285
3
14.3
3
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0
50
34
30
0
34
1.58
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24
2.0
24
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0
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33
10
33
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1.88
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50
2.0
50
100
0
200
34
12
28
26
1.92
8866602--8866675
27
2.7
29
81
14
93
31
8
1
59
1.35
8866739--8866791
27
1.9
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30
5
3
60
1.37
8868602--8868656
29
1.9
28
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101
20
21
25
32
1.97
8870839--8870966
47
2.7
47
86
4
177
25
25
16
32
1.96
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11
3.1
11
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0
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0
50
0
50
1.00
8872903--8872942
6
6.5
6
94
5
71
32
0
15
52
1.43
8872891--8872932
9
4.7
9
81
0
57
33
0
11
54
1.37
8872882--8872955
3
24.3
3
70
8
51
31
0
9
59
1.29
8872894--8872947
12
3.9
15
77
22
64
33
0
12
53
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8873058--8873105
3
16.0
3
91
0
78
31
2
0
66
1.03
8873309--8873440
64
2.1
64
83
11
164
37
4
2
56
1.33
8873371--8873430
20
3.0
18
76
21
57
35
5
1
58
1.30
8873787--8873881
37
2.6
36
78
8
102
36
12
1
49
1.48
8877877--8877920
18
2.4
19
80
3
54
56
0
36
6
1.26
8879131--8879173
21
2.0
21
100
0
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32
9
39
18
1.83
8891860--8891917
21
2.7
22
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10
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18
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3
49.0
3
68
15
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62
1
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1.31
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3
40.7
3
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14
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3
4
26
1.26
8894124--8894208
9
8.9
10
72
18
65
67
3
4
24
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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