Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  307  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102584048--102584133
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1
0
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4.9
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27
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1.98
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2.5
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2.7
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2.5
30
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30
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29
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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52
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2.0
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1.09
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2.0
207
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38
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.9
141
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325
23
28
17
29
1.97
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154
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513
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20
18
30
1.96
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2.1
22
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0
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2.9
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20
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102814078--102814208
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102814078--102814211
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1.97
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41
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0
188
23
28
26
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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3.9
39
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187
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33
15
15
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.91
102883311--102883486
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78
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7.2
6
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5
52
18
18
15
47
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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