Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   

This is table  53  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15510487--15510541
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21
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0
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0
0.85
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0
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1
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77
0
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1
0.86
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2.2
26
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6
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31
0
3
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1.09
15511442--15511575
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69
17
71
29
11
7
50
1.66
15511462--15511625
17
9.5
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9
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122
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15519850--15520664
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192
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30
13
21
34
1.92
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2.6
123
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1
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3.5
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160
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2.1
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17
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17
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2.9
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10
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18
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4.1
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306
29
16
16
37
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15521089--15521298
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2.0
104
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0
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68
0
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2
0
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2.9
16
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0
0
73
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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13
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15522921--15523273
17
19.9
18
69
12
198
30
14
10
44
1.79
15522921--15522989
36
1.9
35
88
2
102
28
14
11
44
1.80
15523007--15523328
34
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72
15
113
30
12
10
46
1.76
15523273--15523328
17
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15
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15
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3
8
50
1.51
15523272--15523323
16
3.2
16
75
5
59
30
3
9
55
1.50
15523277--15523329
15
3.3
15
75
12
52
41
3
9
45
1.54
15523277--15523330
16
3.3
16
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54
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3
9
44
1.54
15524320--15524360
21
1.9
22
85
5
57
31
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19
1.63
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2.0
21
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1.10
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1
26
1.10
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27
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23
2.0
22
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16
58
73
6
2
17
1.15
15527092--15527136
22
2.1
21
83
4
54
73
6
2
17
1.15
15528608--15528650
9
4.9
9
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2
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60
2
0
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1.10
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5.7
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94
0
528
37
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13
31
1.88
15530485--15530806
107
3.0
108
93
1
529
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15
13
31
1.87
15530485--15530792
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1.9
161
93
0
535
37
16
13
31
1.88
15530908--15531066
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2.1
74
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214
33
22
16
27
1.95
15543205--15543259
24
2.2
24
83
3
65
63
5
7
23
1.41
15543519--15543592
33
2.2
33
85
7
94
55
5
2
36
1.37
15543519--15543604
35
2.4
37
83
11
108
55
4
2
37
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15543658--15543696
9
4.3
9
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0
51
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2
0
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1.12
15544312--15544340
14
2.0
15
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51
10
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6
75
1.17
15546067--15546137
36
1.9
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2
99
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1
4
61
1.23
15546088--15546145
18
3.3
18
79
13
59
32
0
3
63
1.11
15546068--15546145
36
2.1
37
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88
33
1
3
61
1.22
15547755--15547779
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1.9
13
100
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48
1.51
15548985--15549084
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3.7
27
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11
89
40
20
10
30
1.85
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37
1.82
15549067--15549246
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2.2
81
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2
191
32
23
7
36
1.82
15549080--15549238
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5.9
27
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23
7
39
1.82
15549161--15549439
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10.3
27
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34
1.82
15549188--15549371
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2.3
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7
190
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20
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1.82
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2.9
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21
20
21
1.96
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1.9
25
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33
22
16
27
1.96
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199
28
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22
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1.99
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1.99
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1.92
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26
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1.25
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2.0
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0
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15553101--15553143
21
2.0
22
90
4
70
55
6
0
37
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15553000--15553185
29
6.5
29
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14
102
61
3
2
32
1.26
15567458--15567685
44
5.2
44
72
3
165
28
23
17
31
1.97
15567458--15567624
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1.9
88
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1.98
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45
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20
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132
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0
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64
2.0
64
93
0
220
38
14
17
29
1.90
15577105--15577192
38
2.3
39
80
5
99
38
17
19
25
1.92
15581817--15581880
25
2.5
26
92
5
105
4
4
21
68
1.27
15582709--15582769
30
2.0
30
90
6
97
42
27
9
19
1.83
15582540--15583508
237
4.1
239
80
8
819
34
19
16
29
1.94
15582951--15583283
163
2.0
162
81
7
379
34
18
16
30
1.93
15583119--15583507
72
5.2
74
79
7
394
32
19
17
30
1.96
15583424--15583596
89
2.0
87
82
7
215
32
20
20
26
1.97
15583340--15583917
163
3.5
164
84
8
713
33
21
18
26
1.97
15583502--15583671
74
2.3
75
86
5
236
32
20
19
27
1.97
15583652--15583686
14
2.5
14
90
0
52
57
5
20
17
1.60
15583583--15583904
178
1.8
175
86
3
466
35
22
17
24
1.95
15583583--15583923
88
3.9
88
87
3
454
35
21
17
25
1.95
15583940--15584127
70
2.6
72
83
1
236
36
23
14
26
1.93
15584315--15584451
70
1.9
70
86
4
195
27
21
18
32
1.97
15584452--15584484
13
2.4
14
95
5
59
57
6
18
18
1.60
15584382--15584696
85
3.6
89
79
12
316
36
21
16
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15584791--15585020
118
2.0
116
83
10
290
39
23
12
25
1.90
15583380--15585072
783
2.1
790
87
8
2469
34
21
16
26
1.95
15586497--15586540
14
2.8
17
83
16
67
0
34
0
65
0.93
15586495--15586540
17
2.6
18
86
10
60
0
32
0
67
0.91
15586903--15587011
30
3.8
28
80
7
78
44
1
19
33
1.61
15586931--15587031
30
3.4
30
84
2
123
43
3
21
30
1.71
15587301--15587510
50
4.0
50
85
8
267
36
17
16
29
1.92
15587301--15587510
104
2.0
105
89
3
325
36
17
16
29
1.92
15587301--15587518
54
4.1
55
86
7
306
37
16
16
29
1.91
15587497--15587531
14
2.5
14
90
0
52
60
2
17
20
1.49
15587777--15587810
16
2.1
16
88
0
50
64
5
11
17
1.45
15587622--15587871
87
2.9
88
80
12
295
36
18
18
26
1.93
15587794--15588111
123
2.6
122
93
1
528
36
21
14
27
1.92
15587929--15588742
191
4.3
192
92
5
1385
34
21
14
30
1.92
15596920--15597270
17
19.9
17
70
13
194
44
10
14
30
1.79
15597584--15597626
16
2.7
16
82
10
52
74
0
0
25
0.82
15597584--15597631
17
2.9
16
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9
60
75
0
0
25
0.81
15597766--15597828
9
6.9
9
75
10
56
0
19
0
80
0.70
15597764--15597828
11
6.3
10
80
18
71
0
20
0
80
0.72
15597764--15597828
20
3.2
20
76
22
71
0
20
0
80
0.72
15598544--15598645
30
3.4
30
84
2
125
44
3
22
29
1.71
15598643--15598677
16
2.1
17
89
5
54
20
0
2
77
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15598643--15598677
17
2.1
17
88
0
52
20
0
2
77
0.90
15600176--15600229
23
2.4
22
82
14
58
31
7
1
59
1.36
15600274--15600328
28
2.0
27
82
3
65
32
9
3
54
1.49
15604142--15604194
19
2.8
19
85
5
63
28
20
5
45
1.74
15608932--15609097
70
2.4
70
89
2
253
27
25
21
25
2.00
15609131--15609296
88
1.9
88
82
5
210
30
18
23
27
1.98
15609126--15609296
45
3.9
44
72
11
125
30
19
22
27
1.98
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2.4
23
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7
0
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1.25
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23
1.9
22
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4
68
32
6
0
60
1.23
15611734--15611788
28
2.0
27
82
3
65
32
9
3
54
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349