Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  73  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21442199--21442246
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22
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31
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.91
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26
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19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.1
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22
0
44
1.53
21530605--21530652
20
2.4
22
76
20
59
70
14
4
10
1.29
21530761--21530858
35
2.7
37
87
12
150
37
10
16
35
1.82
21530761--21530851
19
4.9
19
92
8
161
37
10
15
36
1.83
21530761--21530874
19
5.8
22
87
10
96
36
9
15
37
1.81
21531140--21531173
18
1.9
17
88
5
50
29
0
0
70
0.87
21533496--21533520
3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90
21534103--21534357
130
1.9
132
88
1
388
29
19
17
33
1.95
21534104--21534568
131
3.5
131
79
5
284
27
18
18
35
1.94
21546165--21547345
132
8.9
132
90
0
1777
28
18
25
28
1.98
21549611--21549638
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
21551877--21551913
9
4.1
9
92
0
65
45
13
10
29
1.77
21551962--21552021
30
2.0
31
90
3
95
20
43
0
36
1.52
21552262--21552319
17
3.2
17
79
16
55
24
29
0
46
1.53
21553076--21553131
21
2.7
21
80
0
67
26
7
33
32
1.84
21557286--21557392
26
4.2
26
93
1
189
35
24
7
32
1.83
21564308--21564415
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21565482--21565534
24
2.3
23
80
3
61
39
7
5
47
1.56
21572892--21572925
13
2.6
13
95
0
59
52
11
29
5
1.61
21577757--21578070
45
6.7
45
76
12
231
29
15
25
29
1.96
21577752--21578030
96
2.9
95
87
4
398
30
14
25
29
1.95
21577813--21577985
51
3.5
51
74
13
182
29
13
28
28
1.94
21578621--21578657
19
2.0
19
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5
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72
10
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0
1.10
21578830--21578873
21
2.3
19
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11
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6
18
2
72
1.17
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30
2.9
30
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122
48
0
5
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1.26
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2
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2
84
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46
0
0
53
1.00
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19
3.0
21
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37
18
9
34
1.83
21586333--21586394
19
3.2
19
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4
106
35
17
9
37
1.83
21586517--21586545
7
4.3
7
95
4
51
13
0
0
86
0.58
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11
2.5
11
100
0
54
88
0
11
0
0.50
21590358--21590400
19
2.3
19
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8
52
51
11
4
32
1.59
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43
4.7
43
70
11
144
20
20
22
36
1.95
21592593--21592842
130
1.9
131
85
1
340
19
21
23
36
1.95
21592325--21593217
354
2.5
354
97
0
1678
20
21
23
35
1.96
21592993--21593195
43
4.7
43
72
11
162
20
19
22
36
1.95
21592949--21593196
130
1.9
131
87
1
363
20
20
22
36
1.95
21606989--21607124
26
5.2
26
96
0
227
33
5
24
36
1.79
21611709--21611751
19
2.3
19
84
8
52
51
11
4
32
1.59
21612088--21612129
20
2.2
19
86
4
57
59
4
9
26
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21615498--21615619
9
12.4
9
72
15
75
31
4
1
62
1.24
21615475--21615622
30
4.9
28
76
13
111
33
4
1
61
1.23
21615525--21615621
19
4.8
20
70
14
58
31
3
2
62
1.22
21615498--21615632
10
13.4
10
70
16
75
31
4
2
62
1.27
21617310--21617338
15
2.0
15
93
6
51
68
0
0
31
0.89
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111
3.0
114
78
9
366
16
19
17
46
1.84
21622504--21622599
50
1.9
51
87
6
142
39
11
10
38
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2.2
13
100
0
56
0
0
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9
4.2
9
80
6
51
84
2
7
5
0.84
21633319--21633382
18
3.6
18
76
20
64
79
4
7
7
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349