Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  349  ( 41854 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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88
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50
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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21
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9990035--9990211
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2
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1.27
10020096--10020140
23
2.0
23
86
0
63
55
0
2
42
1.12
10038325--10038363
19
2.1
19
85
0
51
33
2
2
61
1.23
10038324--10038453
12
11.5
11
73
16
79
33
3
0
62
1.19
10038349--10038451
25
3.9
25
73
22
86
33
3
0
63
1.13
10038344--10038453
12
9.6
12
76
15
90
32
3
0
63
1.12
10038347--10038453
33
3.2
33
76
15
105
32
3
0
63
1.12
10038341--10038453
5
22.4
5
69
21
58
33
3
0
62
1.12
10038335--10038450
30
3.7
32
76
18
86
32
4
0
62
1.14
10038349--10038456
55
1.9
57
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7
150
32
3
0
63
1.12
10038721--10038760
13
3.0
13
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20
0
7
72
1.08
10045915--10045942
12
2.3
12
100
0
56
28
7
14
50
1.69
10050618--10051304
90
7.7
90
91
1
1085
29
14
27
28
1.95
10051253--10051623
45
8.1
49
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20
226
30
15
26
27
1.96
10050983--10051623
319
2.0
319
95
0
1147
30
14
27
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10051302--10051758
90
5.1
90
90
3
719
30
14
26
28
1.95
10053327--10053470
12
12.0
12
72
20
97
32
3
0
63
1.16
10053328--10053397
19
4.0
18
72
20
67
30
1
1
67
1.08
10053327--10053497
12
12.6
14
71
21
93
30
3
0
64
1.14
10053327--10053478
23
6.9
22
70
17
95
32
3
0
63
1.16
10053344--10053454
46
2.4
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10
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31
3
0
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1.17
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31
4.5
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72
18
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31
3
0
64
1.15
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14
2.5
13
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17
0
8
73
1.08
10053750--10053778
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2.1
14
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13
0
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1.04
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14
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29
1.74
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2.3
23
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10
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0
0
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1.00
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2.7
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0
1
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1.07
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140
41
0
1
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2.6
20
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29
0
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9
20.7
9
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0
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1.20
10061315--10061390
26
2.8
26
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35
0
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2.2
21
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23
0
6
70
1.10
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19
4.4
19
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17
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2
1
61
1.17
10061448--10061583
37
3.6
37
77
11
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34
2
3
59
1.27
10061517--10061580
27
2.3
27
79
12
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34
3
1
60
1.22
10069498--10069550
22
2.4
22
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63
30
24
18
26
1.98
10069474--10069552
23
3.5
23
77
8
81
26
21
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10080329--10080367
10
3.9
10
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0
60
66
0
15
17
1.25
10081141--10081200
14
4.4
14
71
23
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40
18
3
38
1.67
10081121--10081200
40
2.0
40
100
0
160
37
20
5
37
1.74
10082188--10082221
18
1.9
18
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8
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29
1.75
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2.0
21
100
0
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14
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180
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29
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0
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3.1
31
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38
20
13
27
1.90
10123330--10123383
25
2.1
26
89
3
83
61
1
0
37
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349