Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  63  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Score
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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132
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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0
66
1.10
18659811--18659875
25
2.7
25
80
15
84
27
6
0
66
1.15
18659948--18659981
3
11.0
3
87
6
50
35
0
2
61
1.11
18660188--18660212
11
2.3
11
100
0
50
48
8
8
36
1.62
18660670--18660700
10
2.9
11
90
9
55
19
0
0
80
0.71
18662322--18662389
16
4.2
16
94
0
118
26
1
35
36
1.66
18662625--18662659
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
18662745--18662779
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
18662762--18662936
38
4.5
37
63
19
95
47
5
1
45
1.35
18662608--18663109
120
4.2
120
98
0
979
48
4
2
44
1.36
18662864--18662898
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
18662984--18663018
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
18662608--18663109
239
2.1
240
98
0
979
48
4
2
44
1.36
18666170--18666225
21
2.6
21
91
2
85
41
25
12
21
1.88
18667317--18667432
15
7.5
15
66
24
62
62
12
17
7
1.53
18667297--18667432
33
4.3
33
80
12
185
60
13
18
8
1.57
18667363--18667417
18
3.2
18
71
23
64
60
14
16
9
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18668556--18668608
26
2.0
26
85
7
72
45
3
1
49
1.31
18669082--18669147
14
4.3
15
73
19
55
45
0
1
53
1.09
18675330--18675363
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
18679967--18680000
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
18682277--18682331
13
4.2
13
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0
56
40
27
5
27
1.78
18682281--18682334
26
2.1
26
82
0
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38
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3
27
1.74
18684608--18684663
26
2.2
24
78
6
58
32
0
3
64
1.11
18685403--18685508
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29
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90
27
7
1
63
1.32
18685447--18685498
15
3.5
15
82
10
63
30
7
0
61
1.24
18685478--18685523
15
2.9
15
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6
56
23
6
2
67
1.25
18685392--18685558
87
1.9
86
80
13
191
27
7
2
61
1.38
18685668--18685762
25
3.7
25
70
10
66
31
6
3
58
1.38
18685733--18685786
23
2.5
22
82
8
58
33
0
5
61
1.19
18697767--18697795
15
1.9
15
100
0
58
55
0
20
24
1.44
18700513--18700590
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2.0
39
97
0
147
24
20
21
33
1.97
18700832--18700927
50
1.9
50
86
0
138
35
14
20
29
1.93
18702190--18702224
17
2.1
17
100
0
70
54
5
17
22
1.64
18706213--18706243
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
18707303--18707417
50
2.3
50
86
3
151
40
19
16
24
1.91
18709055--18709099
18
2.4
18
85
7
63
48
0
6
44
1.29
18715296--18715325
12
2.5
12
94
0
51
13
23
20
43
1.86
18715839--18716046
91
2.3
91
86
2
274
45
4
3
46
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18716076--18716107
16
1.9
17
93
6
57
53
0
0
46
1.00
18716100--18716312
59
3.4
63
69
17
203
41
2
6
49
1.42
18716062--18716354
120
2.4
120
90
4
475
42
2
4
50
1.36
18716303--18716337
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
18716291--18716559
147
1.9
143
92
4
459
46
2
3
47
1.32
18716450--18716484
18
2.0
17
94
5
61
48
0
0
51
1.00
18716640--18716734
45
2.1
44
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9
131
33
27
4
34
1.76
18716715--18716764
16
3.1
16
94
0
82
34
36
0
30
1.58
18729439--18729529
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17
55
39
6
15
38
1.73
18731224--18731292
30
2.3
30
89
0
111
39
4
10
46
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349