Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  295  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
1
41
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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1
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62
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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36
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24
19
30
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98891333--98891420
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2.4
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222
2.0
216
86
5
601
31
12
21
34
1.90
98919076--98919147
25
3.0
23
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31
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98919115--98919147
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0
0
33
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20
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30
1.13
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28
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1
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32
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98919206--98919281
23
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1
2
32
1.17
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0
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0
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0
0
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98964998--98965061
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22
1.9
22
100
0
84
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14
21
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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98
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2.0
22
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73
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138
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13
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18
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15
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3.5
37
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14
17
17
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99052453--99052519
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2.7
25
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19
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17
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1.82
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37
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16
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17
3.0
18
86
7
67
14
36
27
21
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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