Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  74  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21634394--21634564
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2
31
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.4
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1.18
21674562--21674623
23
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22
23
1.99
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2.4
245
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20
20
25
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2.0
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1
71
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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18
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28
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21752478--21752511
17
1.9
18
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14
11
1.10
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23
23
48
1.70
21775692--21775748
24
2.4
24
87
0
78
21
29
31
17
1.96
21777114--21777153
2
20.0
2
94
0
71
50
47
0
2
1.14
21797461--21797537
39
2.0
39
94
0
136
35
5
18
41
1.73
21802520--21802603
42
2.0
42
97
0
159
26
20
21
32
1.98
21804517--21804668
43
3.5
42
80
7
155
25
16
26
32
1.96
21804517--21804668
44
3.5
43
79
12
152
25
16
26
32
1.96
21808401--21808444
6
7.5
6
89
5
72
0
15
0
84
0.63
21817995--21818070
40
1.9
40
88
0
116
38
28
13
19
1.90
21825584--21825623
20
2.0
20
95
0
71
15
32
32
20
1.93
21828136--21828185
15
3.1
16
83
11
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50
10
12
28
1.71
21828136--21828187
17
3.2
17
78
10
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50
11
11
26
1.73
21836923--21836997
23
3.1
23
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12
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72
4
4
20
1.18
21846382--21846422
18
2.3
18
95
0
73
4
14
48
31
1.65
21848694--21848765
3
24.0
3
94
0
126
69
0
30
0
0.89
21848854--21848900
21
2.2
21
77
7
51
4
27
12
55
1.56
21855789--21855995
70
3.0
69
86
3
290
25
14
25
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21857356--21857405
10
5.0
10
83
9
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70
2
6
22
1.20
21859232--21859292
12
5.2
11
72
20
52
72
1
1
24
1.03
21859222--21859285
20
3.2
20
78
15
69
71
1
3
23
1.08
21859231--21859295
10
6.8
10
69
20
50
70
1
1
26
1.04
21859247--21859323
35
2.2
35
81
4
93
74
1
3
20
1.06
21865066--21865131
33
2.0
33
100
0
132
21
9
9
60
1.54
21873196--21873269
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2.5
30
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2
105
24
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32
12
1.92
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18
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1
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1.06
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1.9
22
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5
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0
36
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60
1.10
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4.2
17
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17
60
0
32
1
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1.01
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30
3.0
30
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24
33
24
17
1.96
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29
2.9
30
93
3
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25
33
22
18
1.97
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10
5.0
10
83
9
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70
2
6
22
1.20
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2.2
32
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7
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42
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14
28
1.85
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23
2.7
23
80
7
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50
1
0
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1.11
21889152--21889430
43
6.6
43
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29
25
19
24
1.98
21889153--21889430
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3.3
85
84
5
348
29
25
19
24
1.99
21889155--21889430
125
2.2
127
84
3
351
30
25
19
25
1.98
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9
18.7
9
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10
92
33
0
18
46
1.54
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36
3.1
36
87
8
148
34
0
18
46
1.55
21895376--21895484
43
2.5
43
96
0
200
33
0
18
48
1.48
21895640--21895694
15
3.7
15
78
4
67
49
0
3
47
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21895633--21895696
29
2.2
29
94
0
110
50
0
3
46
1.17
21895834--21895885
15
3.5
15
80
15
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50
1
0
48
1.12
21895498--21895956
194
2.4
194
93
2
771
49
6
10
33
1.62
21896255--21896300
24
1.9
24
86
0
65
45
6
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26
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21
2.0
22
86
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63
18
2
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50
1.59
21899074--21899112
7
5.6
7
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0
51
17
2
25
53
1.56
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21
2.2
21
84
0
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21
2
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52
1.58
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0
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1.48
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21
1
30
46
1.59
21899333--21899390
22
2.6
23
76
13
59
24
0
27
48
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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