Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  161  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52010818--52011000
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1.39
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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2.6
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20
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
14
100
0
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14
28
0
57
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52220748--52220784
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45
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1.15
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10
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41
94
2
140
29
2
7
60
1.37
52245948--52245998
17
3.4
15
75
17
52
37
1
0
60
1.08
52245956--52245990
17
2.1
17
100
0
70
48
0
0
51
1.00
52248387--52248466
30
2.6
31
92
3
128
40
1
0
58
1.06
52251577--52251614
20
1.9
20
84
10
51
21
13
2
63
1.42
52251679--52251764
43
2.0
43
93
0
145
47
10
8
33
1.67
52254164--52254239
39
1.9
39
100
0
152
32
15
15
35
1.90
52262130--52262211
26
3.2
26
94
0
146
36
25
6
31
1.81
52264137--52264175
19
2.1
19
90
4
62
28
10
2
58
1.44
52264486--52264523
18
2.1
18
100
0
76
21
28
34
15
1.94
52265791--52265962
93
1.8
93
92
0
290
27
29
21
22
1.99
52265784--52265953
46
3.7
46
78
10
193
28
30
20
20
1.98
52270494--52270616
28
4.4
28
88
2
167
34
27
12
26
1.92
52272159--52272416
40
6.6
39
85
7
249
25
19
28
26
1.99
52272159--52272416
76
3.3
78
82
5
254
25
19
28
26
1.99
52272212--52272416
39
5.3
39
90
4
245
24
20
29
25
1.99
52272170--52272416
78
3.2
79
78
10
206
25
19
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52280060--52280279
40
5.6
40
86
6
254
24
20
28
27
1.99
52280060--52280281
77
2.8
77
85
5
268
23
19
28
27
1.99
52280133--52280314
79
2.3
80
84
1
233
25
20
28
26
1.99
52291533--52291614
21
4.0
21
75
1
76
37
23
19
19
1.94
52291533--52291640
21
5.1
21
76
5
74
37
21
18
22
1.94
52291567--52291639
21
3.4
22
79
7
78
35
20
19
24
1.95
52293247--52293284
19
2.0
20
89
5
60
34
5
5
55
1.45
52301164--52301365
67
3.0
67
85
1
269
22
32
21
23
1.98
52312666--52312706
3
13.7
3
100
0
82
65
0
0
34
0.93
52313472--52313520
25
2.0
25
83
0
62
38
0
16
44
1.48
52318726--52319155
48
9.0
48
96
0
743
34
7
28
29
1.84
52319298--52319440
37
3.9
37
95
0
241
24
18
30
25
1.98
52335890--52336152
49
5.5
48
74
10
204
25
28
18
27
1.98
52335890--52336116
98
2.4
95
81
7
264
25
28
18
27
1.98
52336081--52336198
46
2.5
48
87
2
159
23
30
17
27
1.97
52343705--52343790
42
2.0
42
88
0
127
52
1
23
23
1.54
52346838--52347060
40
5.6
40
85
3
236
26
27
21
24
1.99
52346992--52347069
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
52354742--52354964
40
5.6
40
85
3
236
26
27
21
24
1.99
52354896--52354973
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
52356650--52356683
16
2.1
16
88
0
50
23
14
14
47
1.82
52358135--52358162
14
2.0
14
100
0
56
64
0
28
7
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52359558--52359593
17
2.1
17
100
0
72
30
27
0
41
1.56
52364021--52364060
15
2.6
16
84
11
57
57
15
7
20
1.61
52369000--52369091
39
2.3
39
88
5
132
25
28
22
23
2.00
52368981--52369144
40
4.1
40
80
10
176
24
27
23
25
2.00
52383213--52383283
36
2.0
36
94
0
124
22
30
23
22
1.99
52396263--52396460
39
5.0
39
74
4
180
42
22
8
27
1.81
52396263--52396440
41
4.4
41
76
4
157
42
23
7
26
1.81
52396263--52396459
80
2.5
78
85
4
268
42
22
8
27
1.81
52398407--52398486
39
2.0
40
88
7
119
52
7
15
25
1.68
52400627--52400681
20
2.7
21
86
11
78
30
14
5
49
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349