Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  240  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Score
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1.8
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
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Entropy
(0-2)
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18
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79558475--79558769
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0
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82
11
292
25
27
21
25
2.00
79583695--79583912
39
5.7
40
82
12
226
26
27
21
24
1.99
79583695--79583912
79
2.9
76
79
15
202
26
27
21
24
1.99
79618730--79618840
40
2.8
40
83
1
98
25
28
23
22
1.99
79618753--79618897
40
3.6
40
85
4
184
22
26
24
26
2.00
79635029--79635164
54
2.5
53
74
10
134
32
26
24
16
1.96
79642912--79642961
24
2.1
24
92
0
82
54
2
22
22
1.55
79646213--79646253
21
2.0
21
100
0
82
9
39
29
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1.86
79649155--79649360
53
3.8
54
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1
234
19
24
18
37
1.94
79652165--79652334
44
3.9
44
80
6
213
31
27
15
25
1.96
79653414--79653438
13
1.9
13
100
0
50
40
24
4
32
1.73
79663783--79663839
13
4.4
13
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36
15
0
47
1.46
79663863--79663930
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20
0
42
1.52
79663775--79663915
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3.5
40
70
15
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39
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1
42
1.58
79663771--79663919
80
1.9
79
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9
205
37
18
1
42
1.58
79663783--79663945
27
6.2
24
69
16
85
36
17
1
44
1.60
79667455--79667499
23
2.0
23
91
8
74
51
8
0
40
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79678062--79678225
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3.8
42
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3
157
21
18
27
32
1.96
79681990--79682100
37
3.0
37
93
0
195
31
25
11
31
1.91
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25
3.3
25
80
6
80
25
19
22
32
1.97
79688663--79688969
46
6.5
46
73
13
211
28
17
29
24
1.97
79688662--79689023
46
7.6
50
73
15
206
27
17
29
25
1.98
79689814--79689853
21
1.9
21
100
0
80
12
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35
35
1.88
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25
2.5
25
86
0
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28
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4
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1.62
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2.3
26
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13
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19
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1.57
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1.9
20
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5
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30
5
0
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21
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66
22
1
8
1.29
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11
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11
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20
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1.41
79705733--79705788
22
2.6
21
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60
26
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1.44
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40
6.7
40
94
0
446
30
20
26
22
1.98
79719208--79719458
40
6.3
40
87
4
312
23
19
27
29
1.98
79719208--79719458
79
3.2
80
83
2
328
23
19
27
29
1.98
79719208--79719458
119
2.1
119
84
4
328
23
19
27
29
1.98
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15
9.9
15
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17
55
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20
8
9
1.51
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16
2.3
16
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0
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59
24
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8
1.53
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62
3.0
63
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1
261
60
19
9
10
1.56
79721496--79721548
26
2.0
26
96
0
97
49
9
30
11
1.70
79730512--79730668
34
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35
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189
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7
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43
1.77
79730512--79730668
68
2.3
68
85
4
210
30
7
17
43
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79730674--79730781
36
2.8
40
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12
143
34
3
12
50
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2.1
56
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0
231
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9
23
22
1.81
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2.3
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27
25
2.00
79734825--79735008
40
4.6
40
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23
22
28
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2.00
79734877--79735041
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2.1
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21
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79741496--79741615
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2.1
56
98
0
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9
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232
24
22
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210
25
21
27
25
1.99
79745802--79745893
34
2.7
34
89
3
141
28
8
18
44
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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