Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  48  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13711120--13711341
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16
26
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1.97
13711167--13711353
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1.9
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252
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26
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1.97
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1.29
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45
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.0
21
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0
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13785403--13785627
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13785626--13785836
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2.8
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27
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54
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.4
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144
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2
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0
54
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13873930--13873986
24
2.4
24
79
5
71
49
3
3
43
1.36
13876981--13877024
19
2.3
19
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4
38
1.50
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0
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21
5
14
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13889420--13889556
37
3.5
39
75
10
127
34
23
16
25
1.95
13893685--13893762
40
2.0
40
87
5
113
37
32
14
16
1.89
13899789--13899828
21
1.9
21
84
0
53
37
0
17
45
1.49
13900146--13900360
25
8.7
25
72
10
149
17
25
21
35
1.95
13900177--13900333
48
3.2
48
79
8
140
16
24
22
36
1.94
13900302--13900407
25
4.3
25
69
8
74
21
22
22
33
1.98
13909055--13909083
8
3.6
8
100
0
58
37
0
0
62
0.96
13909161--13909188
8
3.5
8
100
0
56
39
0
0
60
0.97
13909210--13909240
5
6.4
5
92
7
55
41
0
0
58
0.98
13909017--13909221
104
1.9
108
91
7
339
37
2
7
51
1.46
13910502--13910558
15
3.9
15
90
2
89
36
0
12
50
1.40
13910944--13911039
21
4.5
21
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2
120
14
22
26
36
1.93
13910931--13911039
42
2.5
42
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2
146
16
22
24
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1.95
13922921--13922950
11
2.6
11
94
5
51
90
0
0
10
0.47
13932717--13932828
51
2.2
51
88
0
161
25
21
12
40
1.88
13934739--13934773
2
17.5
2
93
0
61
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13936671--13936715
16
2.8
16
86
6
56
44
8
0
46
1.34
13936685--13936715
8
3.9
8
95
0
53
48
9
0
41
1.36
13937848--13937872
13
1.9
13
100
0
50
64
4
24
8
1.38
13947205--13947247
15
2.7
15
82
7
50
51
0
0
48
1.00
13951261--13951356
44
2.2
45
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3
133
34
9
20
35
1.85
13953938--13953983
19
2.4
19
96
0
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26
32
0
41
1.56
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23
2.0
23
100
0
92
30
13
13
43
1.81
13955371--13955413
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2.2
19
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25
0
18
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1.42
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16
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16
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0
108
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26
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1.82
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16
4.5
15
89
6
99
38
6
26
27
1.82
13957888--13957959
32
2.2
32
87
4
110
38
6
26
27
1.82
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44
2.1
46
88
7
140
34
5
24
36
1.78
13958184--13958298
58
2.0
57
83
10
144
53
3
0
42
1.17
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23
2.0
23
100
0
92
43
13
13
30
1.81
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27
2.1
27
100
0
112
25
25
17
32
1.97
13982922--13982946
6
4.2
6
100
0
50
84
0
0
16
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2.3
19
83
0
50
65
0
0
34
0.93
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71
2.0
71
98
0
277
32
13
8
45
1.74
14004586--14004642
23
2.4
24
82
8
71
10
14
7
68
1.38
14004593--14004642
23
2.1
24
88
3
75
12
14
6
68
1.39
14004617--14004684
33
2.1
33
83
5
84
14
11
10
63
1.53
14014132--14014214
42
2.0
42
92
0
139
21
10
16
50
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14014896--14014949
8
7.0
8
76
16
60
16
0
0
83
0.65
14014896--14014923
14
2.0
14
100
0
56
14
0
0
85
0.59
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91
3.7
91
87
3
496
19
23
14
42
1.88
14015582--14015917
183
1.8
183
91
0
555
19
23
14
42
1.88
14015564--14015927
46
8.0
46
89
1
491
20
23
14
41
1.89
14021669--14021702
17
2.0
17
88
0
50
20
44
20
14
1.87
14024635--14024665
14
2.2
14
94
0
53
61
0
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22
1.34
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20.2
4
75
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4
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3
1.30
14025526--14025636
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2.4
47
84
3
152
26
15
22
36
1.94
14036556--14036602
21
2.3
21
82
10
53
31
17
4
46
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349