Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  45  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12742245--12742310
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2.5
26
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1.58
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2.2
20
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9
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1.73
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20
2.5
20
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1.87
12756258--12756425
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4.3
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1.96
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12756356--12756503
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30
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0
0
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3
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1.30
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4.3
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63
2
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28
1.30
12762875--12763024
58
2.6
58
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13
157
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2
5
28
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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2
0
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2.0
59
91
3
191
35
2
0
61
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12763241--12763369
20
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70
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3
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66
1.19
12763639--12763672
17
1.9
18
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5
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50
26
0
23
1.50
12773375--12773417
19
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52
27
6
0
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1.18
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2.0
64
100
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50
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2.0
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36
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21
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25
48
2
23
1.62
12781129--12781198
22
3.3
21
81
15
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30
45
1
22
1.61
12781444--12781715
132
2.1
133
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0
402
33
21
19
25
1.97
12782139--12782186
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20
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6
69
27
0
2
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0.98
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3.2
17
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10
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27
1
0
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0.97
12782219--12782270
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51
26
1
0
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0.97
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3.5
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66
10
9
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75
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12782290--12782333
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18
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79
4
11
4
79
1.02
12784211--12784270
29
2.0
30
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35
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1.94
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3.9
43
88
3
248
29
31
23
14
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12788678--12788785
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38
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1.68
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2.5
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144
27
13
32
26
1.94
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5.1
29
80
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145
27
13
32
26
1.94
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14
2.7
14
95
0
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34
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1.80
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2.1
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7
88
41
7
2
48
1.45
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1.9
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22
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27
1.99
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22
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13
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16
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24
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1.98
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40
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11
22
1.77
12866349--12866492
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111
29
28
19
22
1.98
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2.0
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1.89
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35
12.6
35
73
9
258
26
20
13
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12870034--12870364
71
4.6
72
73
8
278
27
19
13
39
1.89
12869978--12870444
108
4.3
107
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5
395
27
20
13
38
1.90
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145
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349
27
20
12
38
1.89
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16
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18
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0
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34
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1.9
30
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3
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55
0
8
35
1.30
12874092--12874293
44
4.6
44
83
1
226
31
26
12
29
1.93
12874092--12874996
88
10.3
88
73
7
298
27
23
16
32
1.96
12874267--12874634
177
2.1
177
94
0
646
25
22
19
32
1.97
12874573--12874996
44
9.7
44
88
0
589
27
23
15
34
1.94
12887309--12887420
15
7.7
15
64
20
58
60
0
7
32
1.24
12891558--12891659
33
3.1
31
71
22
82
45
1
0
52
1.12
12891611--12891667
30
1.9
30
85
7
80
47
1
0
50
1.11
12891852--12891893
13
3.3
13
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3
50
42
19
2
35
1.64
12893319--12893464
48
3.0
48
86
4
197
19
16
29
34
1.94
12901691--12901736
14
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14
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20
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0
6
19
1.04
12905034--12905062
9
3.3
9
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9
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0
10
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0
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20
1.91
12921192--12921238
18
2.6
18
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6
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19
8
0
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1.10
12924790--12924828
19
2.1
19
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0
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38
2
25
33
1.70
12937173--12937260
23
3.9
24
75
7
87
27
23
18
30
1.97
12944177--12944292
22
5.1
23
86
1
101
27
22
18
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12944227--12944289
22
2.9
22
97
0
117
34
19
17
28
1.94
12946217--12946365
56
2.7
54
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4
181
18
17
34
29
1.94
12948636--12948811
46
3.8
46
79
12
198
21
21
28
28
1.98
12948633--12948804
93
1.8
93
93
0
299
22
21
28
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1.99
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2.6
55
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29
30
25
14
1.95
12964231--12964264
11
3.1
11
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0
50
55
0
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39
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22
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1.98
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2.0
27
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2.0
32
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39
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27
27
1.99
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1.96
13012697--13012840
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2.7
54
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236
33
22
26
17
1.96
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27
5.9
27
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10
173
33
20
25
19
1.96
13019551--13019712
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54
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2
229
33
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25
19
1.96
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40
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203
24
27
23
24
2.00
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228
23
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24
2.00
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2.0
81
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0
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27
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14
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1.95
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5
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5
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7
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22
0
0
77
0.77
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25
0
0
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2.0
17
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0
50
29
0
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1.40
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2.0
22
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0
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1.07
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14
2.1
15
93
6
53
20
10
13
56
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13060405--13060445
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2.0
20
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0
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0
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13
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0
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26
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1.91
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3.7
50
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2
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28
26
19
25
1.99
13072292--13072476
101
1.8
99
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4
264
28
26
19
25
1.99
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2.0
30
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0
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1.87
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0
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100
0
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51
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1
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27
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1.83
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28
3.2
28
96
1
162
21
10
30
38
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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