Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  303  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101459971--101459996
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1.62
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2.00
101499870--101500094
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2.8
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10
267
24
26
22
26
2.00
101499870--101500094
119
1.9
120
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291
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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23
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16
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1.62
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142
16
2
34
46
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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2.0
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22
1.78
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1.95
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2.7
24
77
18
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10
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31
54
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101687655--101687737
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1.16
101687656--101687741
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1
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0
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1.23
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94
0
51
46
6
0
46
1.29
101690076--101690889
220
3.7
220
93
0
1324
33
18
21
26
1.96
101690831--101691747
78
11.8
78
84
4
1197
33
18
23
25
1.96
101690831--101691747
156
5.9
156
91
1
1371
33
18
23
25
1.96
101691761--101691962
45
4.5
46
83
6
245
32
14
27
25
1.94
101691761--101691962
89
2.3
90
84
5
266
32
14
27
25
1.94
101692311--101692366
18
3.5
15
81
18
60
37
10
14
37
1.81
101692317--101692368
17
3.0
17
88
5
86
38
11
11
38
1.78
101692317--101692380
18
3.6
18
89
4
94
39
10
10
39
1.76
101692670--101692704
18
2.0
17
88
5
52
31
0
0
68
0.90
101695036--101695130
3
31.3
3
68
21
56
63
2
5
29
1.28
101695035--101695088
26
2.0
27
82
10
67
64
3
5
25
1.32
101695094--101695139
16
2.9
16
83
6
58
65
0
2
32
1.05
101695082--101695151
18
3.9
17
81
18
72
62
0
4
32
1.14
101695377--101695425
3
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3
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4
2
32
1.26
101697190--101697217
5
5.6
5
100
0
56
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0
0
82
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101697420--101697444
10
2.5
10
100
0
50
44
0
8
48
1.32
101698636--101698699
17
3.6
17
79
8
58
67
1
0
31
1.00
101698656--101698731
18
4.2
19
74
17
63
72
3
1
22
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101698649--101698731
10
9.0
9
69
18
55
71
3
1
24
1.09
101698665--101698733
36
2.0
35
88
8
106
72
4
1
21
1.10
101698668--101698716
26
1.9
25
87
4
71
73
4
2
20
1.10
101698825--101698871
22
2.0
22
88
8
67
46
0
8
44
1.33
101698828--101698879
24
2.3
22
83
6
59
50
1
7
40
1.42
101701906--101701933
9
3.1
9
100
0
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0
0
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0.94
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4.1
17
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8
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1
0
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0.96
101707434--101707502
27
2.6
28
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15
83
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4
1
21
1.10
101707431--101707493
9
6.9
9
80
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1
23
1.09
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7.8
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75
15
55
72
4
1
22
1.11
101707427--101707509
10
9.0
9
69
18
55
71
3
1
24
1.09
101707602--101707648
22
2.0
24
84
8
62
46
0
8
44
1.33
101709336--101709414
19
4.2
19
85
9
108
35
18
8
36
1.83
101709336--101709408
36
2.0
38
89
5
114
35
17
9
36
1.83
101710400--101710461
9
6.9
9
78
16
58
69
3
1
25
1.13
101710400--101710476
17
4.4
17
75
18
70
68
3
1
25
1.14
101710411--101710476
9
7.8
8
71
18
53
69
4
1
24
1.15
101710570--101710616
22
2.0
24
88
8
71
48
0
6
44
1.28
101710573--101710624
24
2.3
22
83
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59
51
1
5
40
1.37
101712305--101712383
19
4.2
19
87
9
117
35
17
8
37
1.81
101712305--101712377
36
2.0
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91
5
123
35
16
9
38
1.81
101713373--101713435
9
6.9
9
77
18
60
69
3
1
25
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101713377--101713452
18
4.3
18
78
17
88
69
3
1
25
1.13
101713388--101713436
25
1.9
26
91
4
82
71
4
2
22
1.13
101713384--101713450
9
7.8
8
72
21
55
70
4
1
23
1.14
101715269--101715347
19
4.2
19
87
9
117
35
17
8
37
1.81
101715269--101715341
36
2.0
38
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123
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9
38
1.81
101716089--101716867
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9.3
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3
1207
25
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22
30
1.99
101717818--101717867
7
6.9
7
84
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50
0
16
0
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0
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2
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0
13
0
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101717814--101717868
29
1.9
29
88
3
85
1
16
0
81
0.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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