Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  46  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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21
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19
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21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13265530--13265607
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2
3
14
1.00
13288715--13288748
15
2.3
15
89
0
50
26
17
11
44
1.83
13292397--13292448
26
2.0
26
96
0
95
23
32
11
32
1.90
13298514--13298554
21
2.0
21
85
0
55
63
17
2
17
1.42
13300479--13300721
74
3.3
73
74
4
211
34
22
11
31
1.90
13306358--13306431
18
4.2
18
71
16
57
60
2
0
36
1.11
13306368--13306415
24
2.0
24
84
8
62
54
2
0
43
1.12
13306362--13306426
32
2.0
34
87
6
98
56
1
0
41
1.08
13306373--13306459
28
2.9
30
75
13
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56
3
1
39
1.24
13309471--13309498
12
2.3
12
100
0
56
7
7
17
67
1.37
13311299--13311351
27
1.9
28
84
3
72
62
3
11
22
1.45
13311299--13311351
28
1.9
27
85
11
72
62
3
11
22
1.45
13322980--13323106
64
2.0
64
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3
184
30
18
14
35
1.92
13323174--13323281
45
2.4
45
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6
130
27
17
22
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1.96
13323202--13323783
134
4.4
132
83
5
728
31
17
21
29
1.96
13323471--13324208
45
16.5
45
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15
378
31
18
21
28
1.97
13323505--13324303
90
8.9
89
72
16
218
31
18
21
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13323505--13323962
224
2.0
225
92
1
769
31
17
21
28
1.96
13323531--13324162
224
2.8
224
84
6
669
31
18
21
28
1.97
13324110--13324294
44
4.2
44
71
19
152
30
19
20
30
1.97
13323615--13324264
224
2.9
223
79
9
512
31
19
21
28
1.97
13324154--13324319
88
1.9
88
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0
287
31
19
18
30
1.96
13325250--13325292
21
2.1
21
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4
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4
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127
2.6
125
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378
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18
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0
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0
0
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24
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4
0
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1.13
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2.3
20
86
6
62
71
4
0
24
1.03
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20
2.0
20
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0
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1.54
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25
2.3
23
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14
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35
11
11
42
1.76
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25
2.2
25
100
0
110
32
10
12
43
1.78
13351425--13351487
25
2.6
24
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7
94
31
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42
1.80
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0
50
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0
8
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1.32
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2.0
57
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10
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1.48
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29
2.9
28
69
7
76
48
9
1
40
1.44
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21
2.4
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10
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23
2
27
1.63
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5.6
5
100
0
56
60
0
0
39
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20
2.2
21
84
7
58
51
4
15
28
1.63
13377095--13377127
7
4.7
7
100
0
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15
12
1.81
13377906--13377948
21
2.0
21
100
0
86
27
13
0
58
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13378805--13378877
27
2.6
28
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8
121
47
1
2
47
1.24
13378964--13379053
40
2.2
41
80
5
103
40
3
3
53
1.34
13384595--13385045
47
9.6
47
92
2
735
33
8
29
29
1.86
13384595--13385045
96
4.8
94
92
2
735
33
8
29
29
1.86
13384595--13385045
143
3.2
143
95
1
797
33
8
29
29
1.86
13387297--13388093
40
20.4
40
90
5
1130
23
22
28
24
1.99
13387713--13387773
28
2.2
29
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5
99
24
24
26
24
2.00
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427
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24
2.00
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2.0
228
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1
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23
23
29
23
1.99
13391500--13391951
47
9.6
47
92
2
735
32
8
29
29
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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