Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  349  ( 41854 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7480354--7480383
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7485543--7485792
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2.1
27
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10
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5
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7504851--7505484
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886
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20
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2.5
24
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6
4
30
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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7529357--7529388
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27
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1.9
17
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
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0
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0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7648917--7648953
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5
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0
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0
0
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2
0
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3.3
49
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2
164
29
20
11
38
1.87
7665204--7665304
28
3.5
29
69
23
95
64
13
10
10
1.50
7665204--7665322
59
2.0
58
91
4
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62
13
12
11
1.56
7666742--7666772
14
2.2
14
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0
53
54
9
0
35
1.33
7675934--7676091
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1.8
86
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2
192
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5
3
40
1.44
7677529--7677564
18
2.0
18
94
0
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27
2
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1.46
7677657--7677776
63
1.9
63
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6
163
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1.60
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25
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18
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7691994--7692037
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0
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17
3.1
17
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15
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37
0
3
58
1.16
7714381--7714419
17
2.3
18
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13
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2
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1.43
7717516--7717561
23
2.0
23
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45
10
6
36
1.65
7717523--7717567
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
24
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8
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68
3
0
28
1.05
7721725--7721770
22
2.2
20
84
7
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4
0
26
1.07
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3
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3
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10
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3
3
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1.32
7722156--7722233
23
3.3
23
80
1
93
30
3
3
61
1.32
7722193--7722236
20
2.2
20
83
0
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6
2
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1.38
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23
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4
2
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0
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0
0
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26
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5
4
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1.40
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1.36
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2.2
23
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28
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0
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1.16
7750097--7750151
10
5.1
10
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38
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0
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2.1
210
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1
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39
2.3
37
82
9
95
47
0
1
51
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7750332--7750393
20
3.2
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0
0
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0.99
7750335--7750409
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4.1
18
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0
1
49
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14
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44
0
0
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2.2
39
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4
122
21
22
26
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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