Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  310  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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1.70
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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14
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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54
1.11
103640031--103640075
3
15.0
3
81
9
56
37
0
2
60
1.09
103640618--103640650
16
2.0
17
88
5
50
42
0
21
36
1.53
103644218--103644384
43
3.9
43
73
9
135
31
25
14
28
1.95
103653063--103653300
49
5.2
40
87
10
138
29
29
8
32
1.87
103652705--103653334
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13.3
47
91
1
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27
30
9
32
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103662497--103662718
107
2.1
107
97
0
417
40
16
8
33
1.79
103662964--103663016
17
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18
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66
5
0
28
1.15
103663929--103663978
18
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19
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12
59
38
0
4
58
1.17
103663929--103663979
19
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20
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3
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103664166--103664213
7
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7
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0
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10
14
1.78
103664163--103664219
7
8.1
7
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0
60
49
26
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15
1.74
103670364--103670413
23
2.1
24
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103672113--103672157
21
2.1
22
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20
1.60
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22
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33
2.0
33
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21
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1.93
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4.7
15
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8
70
57
17
14
10
1.63
103684999--103685067
30
2.3
30
82
7
88
57
17
14
10
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103687997--103688172
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3.8
46
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7
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28
27
19
23
1.99
103696414--103697038
46
13.6
46
92
1
923
40
14
23
21
1.90
103698446--103698496
16
3.3
15
73
13
50
76
0
21
1
0.88
103699923--103700017
25
3.7
25
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1
1
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46
0
1
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1.11
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1.9
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0
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2
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3
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0
0
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21
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1.98
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27
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1.99
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60
2.3
60
80
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26
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1.99
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21
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26
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0
95
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2.0
43
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158
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0
12
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0
0
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52
0
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103765830--103765875
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0
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13
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0
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1.74
103765947--103765995
18
2.8
17
81
9
62
32
10
20
36
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103768218--103768256
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2.4
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51
0
0
48
1.00
103771066--103771241
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4.8
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291
39
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103771204--103771327
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2.8
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200
33
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37
4.8
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282
38
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21
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1.91
103778364--103778487
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200
33
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1.96
103781208--103781816
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4.6
132
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15
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2.0
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0
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25
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1.99
103800360--103800609
100
2.4
103
86
6
337
26
24
28
20
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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