Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15910223--15910265
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20
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1.78
15917964--15918055
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3.5
27
88
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118
28
8
17
45
1.78
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15
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2.0
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3.2
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142
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24
18
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.78
16009859--16010086
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114
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3
74
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31
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5.7
40
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233
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28
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1.9
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1
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17
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1.94
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86
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21
20
1.96
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1.9
32
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55
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2.7
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2.0
17
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1.53
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2.0
93
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361
22
26
29
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16111118--16111209
46
2.0
46
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0
166
27
23
23
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16117022--16117061
19
2.1
19
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12
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21
22
1.99
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0
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20
2.7
20
94
2
90
69
0
28
1
0.99
16148948--16149005
16
3.4
16
80
13
62
68
0
29
1
0.99
16149347--16149394
20
2.4
20
96
0
87
58
0
20
20
1.40
16150608--16150782
53
3.3
53
91
3
271
16
16
22
45
1.85
16150899--16151175
18
14.9
18
71
13
170
34
11
15
38
1.84
16159289--16159370
41
2.0
41
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4
101
34
26
12
26
1.92
16159269--16159423
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3.7
43
75
10
113
32
27
14
25
1.94
16161244--16161388
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3.3
44
70
14
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29
15
25
29
1.96
16161245--16161432
88
2.1
88
94
0
322
29
18
23
28
1.98
16161289--16161433
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3.3
44
69
14
127
28
20
22
28
1.98
16163191--16163227
18
2.1
19
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10
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18
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27
10
1.83
16180234--16180259
8
3.2
8
100
0
52
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0
23
1.50
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23
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23
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40
1.76
16184321--16184488
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3.7
44
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1
192
34
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23
1.95
16186331--16186379
22
2.2
20
77
19
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51
26
4
18
1.64
16187191--16187295
43
2.4
43
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3
122
36
22
14
26
1.93
16188129--16188242
39
2.9
39
88
3
151
26
28
11
33
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16191497--16191555
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2.0
30
83
9
77
23
38
18
18
1.93
16193506--16193648
27
5.3
27
76
9
114
32
11
16
39
1.85
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81
2.3
81
82
1
224
32
10
18
38
1.85
16193525--16193707
27
6.8
27
79
8
167
32
10
18
38
1.85
16197957--16198073
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2.5
47
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2
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21
19
28
30
1.98
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2.0
60
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1.80
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2.0
40
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0
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1.94
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0
106
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32
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0
0
17
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2.1
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0
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0
0
16
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100
0
52
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0
0
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0.62
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4
100
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19
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2.3
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14
19
18
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1.83
16263382--16263415
17
1.9
18
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5
5
14
73
1.21
16266045--16266110
28
2.4
28
94
0
114
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27
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31
1.85
16266216--16266305
28
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27
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119
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24
23
32
1.98
16266216--16266330
55
2.1
55
83
8
144
18
24
21
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16266771--16266809
19
2.1
19
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0
51
15
5
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71
1.26
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2.3
11
100
0
50
20
0
0
80
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2.6
36
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1
5
21
1.12
16272148--16272214
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2.2
31
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71
1
5
20
1.15
16272147--16272214
27
2.5
28
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1
5
20
1.14
16273196--16273285
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2.1
42
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42
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0
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105
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6
6.5
6
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11
53
15
0
0
84
0.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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