Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  183  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59322638--59322986
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2.00
59322638--59322986
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2.00
59327031--59327222
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3.0
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2.3
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197
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39
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28
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6.7
40
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26
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25
2.00
59376345--59376625
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3.5
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25
27
21
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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11
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1.87
59381717--59382071
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4.4
81
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5
378
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10
20
38
1.87
59381734--59382071
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27
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292
29
10
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27
2.9
27
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0
100
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20
2.3
19
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2.4
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24
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22
1.96
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213
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1.95
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1.8
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21
1.95
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6
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25
10
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8
73
28
40
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16
23
1.96
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241
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27
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2.9
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21
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1.99
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10
205
21
21
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.98
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22
21
28
28
1.99
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2.1
37
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11.6
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30
8
31
1.86
59450623--59451171
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2.9
190
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45
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59499596--59499778
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24
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2.00
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93
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2
292
22
20
29
27
1.98
59512904--59513079
46
3.8
46
75
15
191
22
20
28
28
1.98
59512900--59513071
93
1.8
93
91
4
285
22
20
29
27
1.99
59515969--59516023
15
3.7
15
85
9
78
12
16
10
60
1.60
59519311--59519408
16
6.5
15
66
22
53
69
4
1
25
1.12
59519311--59519406
9
10.4
9
73
15
63
69
4
1
25
1.12
59519318--59519383
24
2.8
24
72
17
66
69
3
1
25
1.11
59519311--59519406
18
5.7
17
73
13
74
69
4
1
25
1.12
59528270--59528306
15
2.5
15
90
0
56
13
18
10
56
1.66
59530193--59530250
30
2.0
29
86
3
80
41
8
22
27
1.83
59532681--59532731
15
3.4
15
71
10
50
54
15
19
9
1.68
59535627--59535792
46
3.6
45
76
16
162
27
28
21
21
1.99
59541637--59541728
9
10.4
9
74
15
59
26
1
3
69
1.10
59541645--59541687
10
4.3
10
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5
52
30
2
2
65
1.18
59541645--59541687
19
2.1
21
87
8
63
30
2
2
65
1.18
59542274--59542336
30
2.1
30
96
0
117
23
3
15
57
1.53
59544387--59544412
10
2.6
10
100
0
52
61
7
11
19
1.53
59549552--59549774
39
5.7
40
85
8
266
25
22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59549552--59549774
79
2.8
81
84
9
282
25
22
27
24
2.00
59549552--59549807
79
3.3
79
81
10
217
26
21
27
24
1.99
59551453--59551513
31
1.9
33
83
12
83
60
4
0
34
1.18
59552060--59552134
35
2.2
35
83
7
91
26
2
24
46
1.66
59552217--59552343
48
2.4
52
77
20
138
41
0
14
43
1.46
59552331--59552395
34
1.9
34
84
6
87
35
1
20
43
1.61
59556262--59556299
18
2.1
18
95
0
67
39
10
26
23
1.87
59556882--59556906
7
3.6
7
100
0
50
60
12
0
28
1.32
59560657--59560695
20
1.9
21
94
5
71
46
5
0
48
1.24
59560696--59560733
19
2.1
19
90
5
60
36
0
0
63
0.95
59560696--59560750
18
3.0
18
84
7
58
40
0
1
58
1.09
59560702--59560750
19
2.6
18
83
9
53
38
0
2
59
1.09
59561279--59561326
19
2.6
19
83
6
55
62
2
0
35
1.07
59562654--59562685
3
10.7
3
100
0
64
34
0
0
65
0.93
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18
2.3
18
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8
50
64
4
0
30
1.14
59563641--59563778
10
14.2
10
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11
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47
2
0
50
1.13
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9
9.2
9
72
14
59
39
3
0
57
1.16
59563705--59563777
29
2.5
30
79
18
82
45
4
0
50
1.20
59563905--59563930
13
2.0
13
100
0
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38
7
0
53
1.30
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2.0
36
89
5
112
38
2
28
30
1.71
59579832--59579938
34
3.1
34
79
1
115
42
17
14
24
1.87
59579842--59579951
34
3.2
33
79
2
103
42
16
14
26
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59581484--59581560
34
2.3
34
88
0
118
31
18
19
31
1.96
59584551--59584774
40
5.6
40
86
3
290
26
26
22
24
2.00
59584551--59584774
81
2.8
80
87
4
299
26
26
22
24
2.00
59587029--59587232
40
5.1
40
92
2
304
24
28
25
21
1.99
59592781--59592906
28
4.5
28
87
2
164
24
12
30
32
1.92
59592779--59592906
55
2.3
57
84
2
170
24
12
30
32
1.92
59600780--59600943
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2.2
75
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190
28
10
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35
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16
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2.4
41
87
0
140
19
22
28
28
1.98
59607849--59608026
27
6.6
27
83
3
178
29
28
15
26
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349