Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  83  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24626736--24626806
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30
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1
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2
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23
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
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0
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17
25
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1.8
180
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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11
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1.84
24797619--24797786
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3.1
54
79
10
148
39
22
8
29
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24797902--24797990
27
3.3
27
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19
1.93
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26
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19
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29
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0
350
21
10
22
44
1.83
24815144--24815234
35
2.6
36
79
6
107
31
12
23
32
1.91
24817611--24817945
96
3.5
93
78
8
300
24
28
19
28
1.98
24817609--24817895
48
6.0
48
82
4
292
24
28
19
28
1.98
24823347--24823379
16
2.1
16
94
0
57
33
24
3
39
1.71
24824837--24824869
7
4.7
7
85
14
50
3
12
0
84
0.72
24824832--24824869
14
2.6
14
88
12
51
2
13
0
84
0.73
24833249--24833278
16
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15
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6
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36
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1.92
24833414--24833523
42
2.6
42
95
0
193
29
24
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30
1.96
24839195--24840536
705
1.9
705
84
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1773
30
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18
25
1.98
24841245--24841410
42
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42
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4
201
31
27
14
26
1.95
24845432--24845562
66
2.0
66
86
5
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25
24
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18
1.97
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47
2.7
47
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1
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14
22
1.94
24851043--24851210
40
4.2
40
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1
259
29
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1.99
24856730--24856902
93
1.9
93
85
4
242
24
18
25
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1.98
24859851--24859919
30
2.3
31
80
9
81
11
14
15
57
1.64
24859855--24859919
15
4.4
15
75
9
62
12
15
12
60
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
46
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2
180
20
19
28
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1.97
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30
2.3
30
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0
109
29
30
22
17
1.97
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30
4.8
30
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6
110
25
16
32
25
1.96
24867584--24867718
45
3.0
45
71
8
130
25
17
31
26
1.97
24867568--24867759
90
2.1
90
91
0
303
25
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31
27
1.97
24867596--24867759
15
10.9
15
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5
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25
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1.96
24881187--24881225
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1.9
21
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2
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2
0
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1.08
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0
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1.15
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2.1
16
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0
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0
6
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2.0
24
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0
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0
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24
24
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32
2.4
32
80
0
91
24
24
6
44
1.77
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20
1.9
20
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0
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5
0
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50
0
0
50
1.00
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2.2
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0
0
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2.8
14
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14
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28
17
10
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1.82
24910816--24910919
20
5.1
20
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14
70
49
11
10
28
1.72
24910841--24910929
20
4.4
21
75
12
96
49
7
13
29
1.70
24913874--24913924
20
2.6
20
81
9
61
25
7
15
50
1.71
24915922--24915965
3
15.7
3
78
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2
0
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24915916--24915953
20
1.9
20
100
0
76
65
2
0
31
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24915916--24915998
10
8.4
9
75
17
60
67
1
3
27
1.15
24919643--24919697
27
2.0
28
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10
87
25
27
21
25
2.00
24920229--24920278
22
2.3
22
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0
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31
2.2
31
89
0
100
16
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27
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1.95
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24
2.2
24
89
0
77
36
1
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55
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1.9
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2
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20
2.8
18
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20
24
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1.90
24951354--24951482
67
1.9
67
95
0
231
23
24
13
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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