Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  60  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17441346--17441395
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4
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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52
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52
0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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43
81
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2
40
1.29
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2.5
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51
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4.7
47
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262
30
25
16
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17566168--17566374
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28
1.96
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23
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188
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3
59
1.38
17577192--17577239
20
2.4
19
83
10
60
27
4
4
64
1.30
17577212--17577262
13
3.8
13
80
12
50
35
0
1
62
1.06
17589582--17590554
72
13.0
72
77
11
748
31
15
19
34
1.93
17590130--17590871
148
4.9
146
81
8
821
30
16
19
33
1.94
17589727--17590883
384
3.0
374
80
9
1193
30
15
19
34
1.93
17589668--17590869
456
2.6
456
94
1
2054
30
15
19
33
1.93
17589588--17590871
530
2.4
514
80
9
1415
30
15
19
33
1.93
17590586--17590871
73
3.9
74
84
4
355
31
16
19
31
1.95
17592628--17592902
3
89.3
3
65
21
81
31
6
4
58
1.41
17592579--17592902
179
1.8
179
93
1
569
30
5
4
59
1.39
17592807--17592841
13
2.8
13
86
4
54
28
5
2
62
1.32
17592809--17592845
19
1.9
19
94
0
65
27
5
5
62
1.39
17593073--17593124
3
16.7
3
77
15
52
34
0
1
63
1.06
17610482--17610657
46
3.8
46
77
12
198
21
20
28
29
1.98
17610479--17610650
93
1.8
93
93
0
299
21
20
29
28
1.98
17617587--17617625
2
19.5
2
100
0
78
48
0
51
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17618237--17618278
21
2.0
21
95
0
75
4
30
9
54
1.53
17622145--17622269
39
3.3
38
78
4
119
28
5
24
42
1.77
17626917--17627395
69
6.9
69
73
3
264
21
21
22
34
1.97
17626917--17627255
138
2.5
137
77
3
338
23
21
21
33
1.97
17635688--17635727
21
1.9
21
90
10
64
25
12
7
55
1.63
17646309--17646399
33
2.7
34
80
11
98
34
3
1
61
1.19
17658482--17658861
43
8.8
43
90
2
539
24
20
30
25
1.98
17658482--17658861
129
2.9
129
93
1
627
24
20
30
25
1.98
17658936--17659015
31
2.5
31
81
2
88
61
18
3
16
1.49
17659261--17659306
21
2.2
21
84
0
56
2
50
19
28
1.60
17664887--17665014
9
13.6
9
76
9
121
31
1
21
46
1.61
17664887--17665014
57
2.2
57
84
0
166
31
1
21
46
1.61
17666073--17666112
21
2.0
20
85
14
55
47
7
0
45
1.31
17666156--17666641
64
7.7
64
94
3
835
46
3
10
39
1.56
17669594--17669629
17
2.2
17
95
5
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72
5
0
22
1.05
17669893--17670102
80
2.6
80
82
3
251
37
35
1
25
1.65
17670010--17670095
22
4.0
22
77
6
86
38
32
1
27
1.65
17670000--17670073
29
2.6
29
76
6
78
39
32
1
27
1.65
17670020--17670146
51
2.5
50
76
3
128
40
33
0
26
1.57
17670084--17670183
44
2.3
44
82
6
114
41
33
2
24
1.66
17670577--17670630
14
3.8
14
73
11
56
24
3
24
48
1.67
17670575--17670629
28
1.9
29
88
3
85
25
3
23
47
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17671155--17671312
40
3.8
42
78
6
135
29
24
17
27
1.97
17671155--17671312
43
3.8
42
78
9
155
29
24
17
27
1.97
17671245--17671596
146
2.4
148
81
8
403
27
24
20
27
1.99
17671700--17671741
22
2.0
20
86
9
57
54
0
9
35
1.33
17672346--17672370
7
3.6
7
100
0
50
72
0
0
28
0.86
17673272--17673330
24
2.4
23
78
10
64
57
1
0
40
1.09
17673262--17673325
25
2.6
26
85
7
80
59
1
0
39
1.07
17678220--17678339
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2.3
53
95
0
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25
1.98
17682320--17682394
37
2.0
37
86
0
105
18
14
30
36
1.91
17682384--17682461
37
2.1
37
83
4
95
16
15
29
38
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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