Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  120  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.51
Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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23
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26
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26
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23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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28
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1.97
38275394--38275571
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3.3
55
80
10
204
28
28
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1.97
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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51
3.9
49
84
5
234
27
17
25
30
1.97
38309901--38309984
26
3.2
26
94
0
141
34
4
23
36
1.76
38314584--38314640
29
1.9
30
92
3
98
54
14
5
26
1.61
38314675--38314717
22
2.0
22
85
0
59
55
9
13
20
1.66
38315898--38315937
19
2.1
19
95
0
71
60
5
10
25
1.49
38324660--38324739
42
1.9
42
94
0
142
31
2
16
50
1.58
38327500--38327545
23
2.0
24
86
4
67
65
0
17
17
1.28
38328345--38328387
22
2.0
22
82
13
54
13
27
6
51
1.67
38329713--38329749
19
1.9
19
94
0
65
37
16
5
40
1.71
38331801--38331835
17
2.1
17
100
0
70
11
5
22
60
1.52
38335148--38335215
31
2.2
31
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2
120
33
11
10
44
1.75
38344006--38344067
25
2.5
24
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15
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29
9
1
59
1.38
38344122--38344154
17
1.9
17
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0
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27
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57
1.53
38344543--38344567
13
1.9
13
100
0
50
44
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0
48
1.32
38348657--38348771
29
4.0
29
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2
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29
13
27
28
1.95
38354107--38354435
48
6.9
48
95
0
514
34
6
29
30
1.82
38354576--38354752
37
4.8
37
94
0
309
24
18
31
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7.5
8
84
1
75
44
30
8
16
1.78
38358777--38358819
16
2.7
16
85
7
61
53
18
20
6
1.67
38359048--38359115
29
2.4
29
85
2
84
27
17
26
27
1.98
38364877--38364919
14
3.1
14
74
12
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39
4
0
55
1.20
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17
2.1
17
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0
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22
22
30
25
1.99
38376707--38376751
12
3.6
13
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55
0
4
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1.20
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3.2
9
100
0
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0
13
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1.32
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39
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398
28
27
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20
1.99
38386791--38387047
39
6.5
39
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1
390
29
29
22
18
1.98
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11
336
31
19
23
25
1.98
38394572--38395353
263
3.0
263
87
3
1030
31
18
23
25
1.98
38397165--38397226
25
2.5
24
80
15
63
29
9
1
59
1.38
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17
1.9
17
93
0
57
27
6
9
57
1.53
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42
3.5
42
79
2
156
30
18
22
29
1.97
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38
2.1
38
90
0
122
20
32
22
24
1.97
38423092--38423359
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5.7
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73
12
189
27
17
29
25
1.98
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50
2.5
51
87
5
181
35
16
22
25
1.94
38426184--38426332
31
4.8
31
84
3
201
27
18
26
27
1.98
38426357--38426521
47
3.7
46
82
6
160
29
15
26
29
1.96
38426451--38426565
42
2.7
43
86
4
162
30
13
26
28
1.94
38428776--38429039
47
5.7
47
76
7
211
23
26
19
29
1.98
38431833--38431870
18
2.1
18
100
0
76
50
13
10
26
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38433861--38434013
39
3.9
39
92
0
252
21
22
30
26
1.99
38433861--38434059
78
2.6
78
86
3
240
21
22
29
27
1.99
38434007--38434081
39
1.9
39
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5
89
21
21
28
29
1.98
38437575--38437657
42
2.0
42
90
4
132
34
13
20
31
1.91
38443250--38443301
27
2.0
26
84
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17
26
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1.95
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4.8
40
80
8
210
24
22
27
25
2.00
38453361--38453515
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2.0
79
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7
199
25
21
27
25
1.99
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1.44
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3.7
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6
137
22
29
19
28
1.98
38468588--38468772
40
4.6
40
81
9
216
24
27
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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