Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  264  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87906681--87906721
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2.0
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4.8
48
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1.98
88252159--88252455
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19
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4.1
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19
19
19
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2.2
12
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6.6
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6
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1.97
88268800--88268976
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3.3
54
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196
28
27
16
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1.97
88268821--88268975
81
1.9
81
85
5
215
28
27
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
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20
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1.97
88281377--88281476
38
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38
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23
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1.98
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39
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302
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21
27
25
1.99
88283704--88283965
118
2.2
120
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335
25
21
27
25
1.99
88291892--88292152
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2.0
55
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13
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5.6
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247
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27
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24
1.99
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1.97
88314629--88314701
30
2.4
30
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15
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1.96
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6.6
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83
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205
26
15
28
29
1.96
88324480--88324635
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
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1.96
88324476--88324656
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2.2
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83
2
229
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15
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1.96
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4.7
33
70
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30
19
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1.98
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243
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1.86
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13
100
0
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17
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
27
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12
38
1.72
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49
4.8
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4
286
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17
26
30
1.97
88343844--88344082
101
2.4
100
84
2
320
26
17
26
30
1.97
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2.0
24
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0
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31
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1.91
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23
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1.96
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1.96
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28
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1.99
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10.9
40
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624
26
30
21
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88390167--88390609
80
5.5
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26
30
21
21
1.99
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46
3.4
46
95
0
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31
10
35
1.88
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3.8
46
92
0
274
23
32
9
34
1.87
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24
63
28
28
12
30
1.92
88400290--88400993
27
26.0
27
73
9
213
36
20
8
33
1.84
88400587--88400741
55
2.8
53
82
7
168
41
21
7
29
1.81
88400613--88400741
55
2.4
54
85
6
170
39
20
8
31
1.83
88400880--88401010
54
2.4
54
88
0
181
40
20
8
30
1.82
88400860--88401012
27
5.7
27
79
6
148
40
22
7
29
1.82
88401031--88401104
27
2.7
27
76
12
71
37
20
20
21
1.94
88401816--88401902
20
4.3
20
89
2
131
40
9
19
31
1.83
88401952--88402084
52
2.6
51
89
4
200
30
21
21
27
1.98
88401952--88402082
26
5.2
26
86
2
180
29
21
20
28
1.98
88402220--88402311
42
2.2
42
90
0
139
30
14
20
34
1.92
88402335--88402413
31
2.5
30
90
8
122
31
18
24
25
1.98
88407988--88408036
26
1.9
26
87
4
73
57
2
2
38
1.22
88407988--88408037
25
2.0
25
84
7
66
58
2
2
38
1.21
88408189--88408237
18
2.7
18
80
0
62
38
22
32
6
1.79
88408626--88408654
15
2.0
15
93
6
51
58
0
6
34
1.25
88409993--88410078
43
2.0
43
97
0
163
32
22
13
31
1.93
88427501--88427526
8
3.2
8
100
0
52
46
23
0
30
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88442114--88442210
29
3.5
28
76
9
92
31
27
13
26
1.94
88446613--88446643
15
2.1
15
100
0
62
48
12
12
25
1.77
88505821--88505893
15
4.9
15
84
0
92
15
16
13
54
1.71
88514333--88514651
48
6.6
48
83
1
370
27
28
17
26
1.98
88514336--88514651
95
3.3
96
84
1
366
27
28
17
26
1.98
88514333--88514651
143
2.2
145
84
1
408
27
28
17
26
1.98
88518530--88518673
46
3.1
46
73
14
143
29
28
19
22
1.98
88520399--88520439
15
2.7
15
88
0
64
58
9
17
14
1.62
88523388--88523558
93
1.8
93
89
2
272
27
28
21
22
1.99
88523380--88523553
46
3.8
46
76
14
187
28
27
20
22
1.99
88523382--88523573
46
4.1
47
71
16
143
28
27
20
22
1.99
88524558--88524986
214
2.0
214
95
0
777
30
16
24
28
1.96
88524968--88525290
104
3.1
104
86
0
448
33
16
21
28
1.95
88527458--88527519
30
2.1
30
96
0
115
33
6
29
30
1.83
88536191--88536422
48
4.8
48
78
4
234
24
27
18
29
1.98
88544921--88545070
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
88544945--88545128
67
2.8
64
76
8
185
30
17
29
22
1.96
88547448--88547507
30
2.0
30
86
0
84
28
23
8
40
1.83
88551436--88551484
23
2.1
23
92
0
80
51
26
0
22
1.49
88557734--88557966
48
4.8
47
75
7
209
25
28
17
28
1.97
88563915--88563948
16
2.2
15
89
5
50
55
0
0
44
0.99
88566840--88566871
16
2.0
16
100
0
64
25
31
31
12
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88589750--88589802
27
2.0
27
85
3
72
28
11
20
39
1.87
88591072--88591219
48
3.1
47
87
1
197
38
8
24
29
1.84
88593379--88593582
40
5.1
40
90
2
295
22
22
28
26
1.99
88601700--88601801
43
2.4
43
93
0
177
15
26
33
24
1.95
88602086--88602131
19
2.4
19
96
0
83
2
23
43
30
1.66
88610530--88610701
40
4.3
40
88
2
222
25
27
21
25
1.99
88610532--88610754
40
5.6
39
83
5
216
25
27
21
25
1.99
88610530--88610754
80
2.8
79
80
7
240
25
27
21
25
1.99
88610686--88610763
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
88617583--88617806
40
5.7
40
82
7
233
25
27
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349