Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  50  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14328688--14328742
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18
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15
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0
0
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0.91
14328750--14328800
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52
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1.36
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2.5
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85
0
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52
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1.63
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2.6
18
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36
0
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1.08
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0
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13
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1.83
14336484--14336578
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2.4
40
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20
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14362472--14362575
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1.9
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35
22
24
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1.95
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4.3
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22
23
17
1.95
14370528--14370642
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2.1
54
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160
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0
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1.97
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2.0
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3.9
17
75
0
60
28
21
22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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4.0
26
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18
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0
0
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4.0
26
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0
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7
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36
1.84
14412405--14412493
40
2.2
40
85
0
124
39
20
12
28
1.88
14426771--14426919
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7
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1.60
14429327--14429355
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2.0
15
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51
20
0
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55
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22
17
1.97
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1.97
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4.5
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25
1.99
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2.6
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4
2
45
1.33
14454952--14454983
15
2.1
15
94
0
55
59
0
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1.29
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57
0
4
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1.19
14459814--14459881
24
2.8
24
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93
29
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14460058--14460113
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46
0
0
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1.00
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12
0
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1.48
14460218--14460443
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12.3
18
75
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161
47
12
0
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1.48
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114
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313
47
12
0
38
1.48
14466487--14466610
43
2.9
43
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25
28
23
23
2.00
14466508--14466610
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2.4
43
91
1
181
23
32
23
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14470122--14470189
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24
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19
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0
0
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1.00
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76
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143
47
12
0
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1.48
14470524--14470749
18
12.3
18
75
9
161
47
12
0
38
1.48
14470552--14470773
114
1.9
114
86
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313
47
12
0
38
1.48
14476771--14476999
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5.3
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255
22
28
22
26
1.99
14476794--14476993
43
4.7
43
92
0
310
22
31
22
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1.98
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0
0
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142
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1.92
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1.10
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0
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1.13
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1.53
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2.1
33
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0
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2.3
38
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135
47
37
5
10
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14550837--14550937
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2.5
40
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1
150
47
19
9
22
1.79
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15
2.7
15
88
0
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14
1.67
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37
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1.54
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3
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1.46
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41
3.9
42
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173
18
21
22
37
1.95
14555435--14555460
12
2.2
12
100
0
52
46
30
15
7
1.74
14555770--14555878
48
2.3
48
91
0
173
42
16
13
27
1.86
14555818--14555950
64
2.1
64
91
0
212
47
16
12
23
1.81
14556042--14556145
6
17.8
6
71
5
52
54
17
5
22
1.63
14556063--14556137
18
4.2
18
73
8
64
54
14
6
24
1.64
14556155--14556210
12
4.7
12
82
8
60
62
8
3
25
1.41
14556164--14556209
6
7.7
6
85
9
58
67
8
2
21
1.29
14556157--14556210
18
3.0
18
83
5
65
64
7
3
24
1.35
14556756--14556816
31
2.0
30
81
15
72
18
8
22
50
1.73
14560652--14560707
26
2.2
26
83
0
67
17
12
12
57
1.66
14566279--14566326
24
2.0
24
83
4
60
62
6
16
14
1.51
14568352--14568958
44
13.3
44
68
11
172
28
21
20
30
1.98
14568643--14568750
50
2.1
51
81
1
119
26
19
24
29
1.98
14568453--14568892
233
1.9
234
82
3
564
28
20
21
29
1.98
14569541--14569592
25
2.1
25
85
0
68
23
19
17
40
1.91
14579582--14579743
54
3.0
53
83
3
200
25
14
26
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14579690--14579843
47
3.2
47
84
5
186
26
13
25
34
1.93
14583950--14583997
19
2.6
19
90
3
80
37
2
12
47
1.53
14585330--14585435
40
2.7
40
85
5
144
22
26
25
25
2.00
14587397--14587480
26
3.2
26
93
0
141
34
7
23
34
1.82
14588923--14588997
26
2.8
26
85
4
87
34
21
12
32
1.90
14589101--14589267
27
6.2
27
89
2
228
18
23
22
34
1.96
14592502--14592540
19
2.2
19
86
9
55
2
25
17
53
1.56
14598129--14598187
22
2.6
22
76
15
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61
3
1
33
1.23
14598193--14598428
43
5.5
43
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5
237
25
17
28
28
1.97
14600356--14600422
29
2.3
29
81
2
71
28
20
5
44
1.75
14607309--14607566
136
1.9
133
85
3
356
32
18
22
26
1.97
14607532--14607651
43
2.7
43
80
5
125
31
20
18
29
1.96
14609063--14609093
13
2.5
12
90
10
53
16
3
0
80
0.83
14609065--14609103
17
2.4
16
79
8
51
17
5
2
74
1.12
14617163--14617318
40
3.9
40
88
5
235
24
23
28
23
1.99
14625163--14625318
40
3.9
40
88
5
235
24
23
28
23
1.99
14633743--14633768
11
2.4
11
100
0
52
46
19
0
34
1.50
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48
2.3
48
84
9
136
35
8
5
50
1.55
14635008--14635050
7
6.0
7
86
2
59
23
6
13
55
1.62
14635008--14635050
14
3.0
14
93
3
68
23
6
13
55
1.62
14635046--14635112
7
9.6
7
100
0
134
28
0
14
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1.39
14635512--14635543
7
4.6
7
96
0
55
31
0
9
59
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14635095--14635961
444
2.0
444
92
0
1455
30
17
22
29
1.96
14636138--14636180
18
2.4
18
92
0
68
20
27
9
41
1.83
14639647--14640024
126
3.0
126
87
3
521
25
22
18
33
1.97
14640673--14640737
23
2.7
23
85
4
85
55
27
0
16
1.42
14641064--14641112
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2.0
24
96
0
89
36
20
30
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1.89
14644231--14644282
20
2.8
19
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21
56
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1
1
48
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14644240--14644285
20
2.3
20
88
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43
2
2
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5
0
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1.26
14654653--14654726
29
2.5
29
86
4
94
22
13
14
48
1.79
14656469--14656510
13
2.9
14
79
13
50
52
0
2
45
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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