Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Number
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Score
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50
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17
17
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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50
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17
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2.2
26
96
0
103
30
5
26
37
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16464372--16464423
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2.0
25
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11
26
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16468544--16468589
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2.2
21
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2
7
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1.38
16475825--16475867
16
2.7
15
82
7
50
48
0
6
44
1.29
16477464--16477529
13
5.1
13
81
0
87
31
4
25
37
1.76
16487873--16488189
166
1.9
166
95
0
571
38
9
21
31
1.85
16490771--16490848
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2.0
40
84
0
102
20
8
21
48
1.77
16490783--16490859
40
1.9
40
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0
91
22
10
20
46
1.80
16493370--16493443
21
3.5
21
77
0
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33
35
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16
1.89
16494478--16494514
3
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3
100
0
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0
32
0
67
0.91
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9
2.9
9
100
0
52
0
34
11
53
1.37
16516298--16516338
11
3.7
11
80
0
55
19
14
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56
1.66
16516561--16516594
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12
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0
50
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0
0
32
0.91
16516720--16516764
21
2.1
21
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0
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8
1.69
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28
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2
2
32
1.20
16519312--16519363
19
2.7
19
81
0
68
63
3
3
28
1.30
16519312--16519372
29
2.1
29
82
14
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60
3
3
32
1.29
16519313--16519435
9
13.0
9
67
24
58
60
3
4
30
1.33
16519322--16519392
29
2.4
29
86
4
90
60
2
4
32
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16519601--16519637
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1.9
19
89
10
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27
2
5
64
1.28
16519612--16519717
29
3.8
28
71
10
74
29
2
2
65
1.21
16519611--16519717
10
11.3
10
69
13
57
28
2
2
65
1.21
16546105--16546214
26
4.2
26
97
0
184
33
5
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1.79
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27
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1
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18
23
24
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1.96
16547851--16547979
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2.4
54
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18
22
21
37
1.94
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46
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13
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22
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1.96
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1.97
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33
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0
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0
0
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19
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34
7
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1.85
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19
2.0
20
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2
5
15
1.04
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2.0
13
100
0
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0
0
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2.5
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0
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27
16.7
27
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20
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1.80
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2.9
79
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333
43
23
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28
1.75
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2.7
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154
43
15
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1.78
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2.5
22
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0
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11
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21
21
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28
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16580443--16580614
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94
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4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16583884--16583971
30
3.0
30
81
8
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10
17
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3.8
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10
188
21
18
30
30
1.97
16586347--16586518
93
1.8
93
91
0
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20
19
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29
1.97
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18
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52
0
26
0
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1
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2.0
23
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5
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31
1.50
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23
2.5
20
80
13
54
55
7
1
35
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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