Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11277856--11277899
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2.0
22
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0
0
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1.00
11277852--11277899
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2
89
47
0
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1.30
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0
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1.13
11278832--11278896
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3.2
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1.30
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0
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2.2
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2
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9
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1.82
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70
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3
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11291306--11291378
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1.11
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12.6
9
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13
69
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3
0
64
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
0
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1.13
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2.1
39
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30
4
0
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1.14
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2.8
18
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28
1
1
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1.12
11291306--11291410
48
2.1
50
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3
0
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11292751--11292858
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15
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25
21
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1.78
11294468--11294506
19
2.0
20
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53
0
0
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1.00
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2.1
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2.0
72
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0
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20
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1.58
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19
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0
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2.5
20
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0
0
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2.3
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17
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59
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0
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100
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35
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11341401--11341454
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2.1
26
86
10
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1
5
31
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.9
17
100
0
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0
0
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11
140
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2
3
51
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2.4
15
90
0
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36
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52
1.46
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1.9
18
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1.47
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2
63
1.22
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2.9
123
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27
1.98
11380912--11381263
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30
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0
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0
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19
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19
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0
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0
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31
90
0
187
26
18
28
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11398213--11398308
29
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0
111
34
10
27
28
1.89
11398298--11398496
33
6.0
33
85
2
247
34
8
21
36
1.83
11401775--11401809
17
2.1
17
100
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0
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78
2
0
19
0.86
11409188--11409229
17
2.6
15
85
14
57
78
2
0
19
0.86
11411124--11411215
31
3.0
31
84
7
91
48
14
15
21
1.80
11411145--11411224
31
2.5
31
88
6
108
47
16
12
23
1.80
11418450--11418496
23
2.0
23
88
8
69
38
6
0
55
1.26
11418540--11418586
20
2.3
20
78
7
51
76
2
2
19
0.99
11419136--11419184
20
2.5
19
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12
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34
10
2
53
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100
0
50
0
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68
0.90
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13
2.1
13
100
0
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0
29
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1.58
11426021--11426068
19
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19
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35
2
14
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1.56
11429807--11429856
19
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2
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1.57
11434762--11434804
23
1.9
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2
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1.20
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2.0
20
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20
2.0
20
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0
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24
3.8
24
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0
148
36
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11
19
1.88
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48
2.8
48
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0
151
35
29
11
23
1.91
11448602--11448738
72
1.9
72
87
0
202
35
30
11
22
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
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0
0
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36
0
5
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1.26
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17
1.9
17
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0
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0
3
54
1.15
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25
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0
2
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1.09
11451392--11451439
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0
2
60
1.09
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35
1
4
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1.32
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1.9
33
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1.80
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0
0
57
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1
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0
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0
0
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18
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51
5
0
43
1.24
11465159--11465183
11
2.3
11
100
0
50
20
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12
52
1.75
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0
5
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1.21
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1.9
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100
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2.0
93
96
0
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36
15
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1.79
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1.9
31
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91
50
1
0
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1.11
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2.4
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70
39
0
0
60
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1.9
28
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90
61
3
0
34
1.14
11485694--11485759
27
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25
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1
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1.21
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16.5
2
100
0
66
51
48
0
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11501734--11501841
55
2.0
55
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0
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40
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27
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25
2.0
25
95
0
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12
30
12
44
1.78
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2.3
16
90
0
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8
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1.52
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3.6
35
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115
35
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10
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19
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5
0
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9
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11
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55
1
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100
0
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349
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16
14
31
1.89
11512726--11512936
77
2.7
76
84
2
253
36
19
14
30
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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