Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  223  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73007018--73007074
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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G
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Entropy
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0
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58
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29
22
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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23
1.99
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10
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27
22
22
1.99
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2.5
39
87
6
132
37
19
26
15
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
24
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0
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27
6
34
1.82
73200428--73200753
50
6.5
50
76
4
323
30
25
19
25
1.98
73200563--73200752
101
1.9
101
86
0
272
30
24
20
25
1.99
73200428--73200754
151
2.2
151
93
1
566
29
25
18
25
1.98
73216192--73216224
11
3.2
11
83
16
52
51
0
0
48
1.00
73216192--73216252
20
3.1
19
88
9
79
52
3
0
44
1.17
73216194--73216254
28
2.2
28
85
5
79
50
3
0
45
1.17
73216231--73216283
26
2.0
26
82
7
63
52
3
0
43
1.19
73216718--73216758
20
2.0
20
85
0
55
34
60
0
4
1.18
73218910--73218959
18
2.8
18
100
0
100
56
0
0
44
0.99
73219488--73219520
14
2.3
15
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5
50
15
3
6
75
1.11
73224145--73224226
42
2.0
42
87
0
119
34
24
13
28
1.93
73226357--73226390
2
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2
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0
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0
50
0
1.00
73227746--73227798
25
2.1
26
83
16
67
20
33
1
43
1.63
73230026--73230114
46
1.9
46
90
0
142
29
29
21
20
1.98
73231584--73231623
21
2.0
21
90
5
64
22
27
40
10
1.86
73232719--73233033
47
6.6
48
72
13
208
24
28
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73240439--73240610
48
3.7
44
75
12
139
25
30
17
26
1.97
73250457--73250490
17
1.9
17
88
5
50
14
44
29
11
1.81
73258455--73258488
17
1.9
17
88
5
50
14
44
29
11
1.81
73258779--73258861
41
2.0
41
100
0
166
51
4
16
26
1.64
73259099--73259162
29
2.1
31
83
11
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34
0
4
60
1.17
73259140--73259164
8
3.1
8
100
0
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24
0
0
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0.80
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2.3
18
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0
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2
19
1.29
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28
3.2
27
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4
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21
24
20
1.98
73270171--73270235
28
2.3
28
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0
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6
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33
1.82
73277783--73277873
28
3.2
28
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4
139
31
23
24
20
1.98
73277979--73278043
28
2.3
28
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0
103
32
7
27
32
1.85
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38
3.5
38
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157
30
24
23
21
1.99
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39
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0
482
22
21
26
30
1.99
73292902--73293157
39
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39
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0
458
21
21
27
29
1.98
73297607--73297742
47
3.0
44
77
17
143
24
16
31
27
1.97
73297614--73297825
46
4.6
46
74
8
157
25
16
30
27
1.97
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40
4.6
41
81
12
215
25
22
27
25
2.00
73315114--73315297
79
2.3
81
82
10
220
25
22
27
25
2.00
73315166--73315330
79
2.1
79
82
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192
26
21
27
24
1.99
73323085--73323230
41
3.6
41
90
4
242
23
25
26
23
2.00
73324596--73324778
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200
25
26
22
25
2.00
73332404--73332571
40
4.2
40
81
4
97
25
26
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73332427--73332571
40
3.6
40
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184
23
25
24
26
2.00
73338766--73338811
14
3.1
15
81
15
51
41
0
2
56
1.11
73338971--73339000
13
2.2
14
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83
6
6
3
0.90
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23
1.9
23
100
0
88
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1.90
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42
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0
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10
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1.86
73365750--73365820
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3.4
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1
108
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0
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1.98
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22
20
23
1.97
73378255--73378288
15
2.5
13
82
17
50
5
11
58
23
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349