Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1180182--1180237
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19
1.9
19
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0
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0
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0
0
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2.0
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12
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.0
22
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1214770--1214931
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155
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0
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2.0
141
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24
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2.7
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10
0
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0
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19
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23
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18
21
27
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
90
2
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22
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31
1.97
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3.2
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10
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3
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2
24
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0
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1.30
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0
2
25
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18
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20
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0
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59
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50
0
5
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0
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13
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0
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1.9
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6
86
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0
160
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0
0
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0
504
27
6
24
42
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1388825--1388880
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18.7
3
100
0
112
32
0
0
67
0.91
1388881--1389140
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0
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24
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15
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0
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1.07
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17
2.3
17
82
8
53
43
12
0
43
1.42
1424927--1425059
66
2.0
66
100
0
266
27
18
29
25
1.98
1427345--1427487
75
1.9
75
95
0
259
25
16
26
30
1.97
1428228--1428268
15
2.9
14
85
7
64
56
2
0
41
1.13
1437751--1438123
130
2.9
130
80
2
399
28
17
18
35
1.94
1440267--1440298
16
2.0
16
93
0
55
25
15
18
40
1.90
1459422--1459460
17
2.3
17
95
0
69
69
0
2
28
1.02
1459437--1459555
62
1.9
62
94
1
213
52
4
4
39
1.40
1459629--1459695
17
3.8
18
75
14
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53
1
0
44
1.09
1459757--1459803
19
2.8
16
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15
58
48
2
6
42
1.40
1459762--1459800
19
2.1
19
90
4
62
53
2
7
35
1.43
1461071--1461115
21
2.1
21
100
0
90
60
13
0
26
1.34
1461173--1461238
34
1.9
35
90
3
107
59
0
1
39
1.07
1461354--1461410
18
3.2
19
73
12
66
57
0
0
42
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1475037--1475109
18
3.9
19
80
5
87
47
15
6
30
1.71
1475326--1475350
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
1476125--1476166
17
2.4
17
88
4
57
0
28
0
71
0.86
1478599--1478623
13
1.9
13
100
0
50
80
0
16
4
0.87
1478677--1478720
20
2.1
21
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4
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77
0
22
0
0.77
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2.9
46
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0
259
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14
25
24
1.93
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16
2.4
16
100
0
78
35
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25
23
1.94
1485833--1486473
341
1.9
341
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1
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34
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26
1.96
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30
2.1
30
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0
99
22
3
14
60
1.48
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18
2.2
18
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20
2
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65
1.38
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30
2.1
30
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0
108
25
3
15
55
1.55
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9
4.9
9
84
13
56
31
0
2
65
1.05
1501985--1502027
20
2.0
22
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8
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30
23
0
46
1.52
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24
2.1
24
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7
84
46
0
12
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1.41
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21
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22
0
8
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1.15
1507394--1507443
26
2.0
26
92
7
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32
0
4
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1.12
1522262--1522320
20
3.0
20
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11
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3
45
1.47
1525102--1525136
17
2.1
17
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0
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42
8
14
34
1.76
1526328--1526385
18
3.2
18
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11
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3
0
29
1.07
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79
2.8
80
82
7
278
25
27
21
25
1.99
1528532--1528755
40
5.7
40
85
6
262
25
27
21
25
1.99
1530406--1530435
14
2.1
14
93
0
51
53
0
3
43
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1531566--1531607
15
2.9
14
82
10
57
35
0
11
52
1.38
1532007--1532066
21
2.9
21
84
0
75
13
23
26
36
1.92
1535374--1535421
24
2.0
24
100
0
96
50
8
4
37
1.52
1535595--1535634
21
1.9
21
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10
55
32
17
20
30
1.95
1537026--1537088
30
2.1
30
93
0
108
28
4
9
57
1.51
1537207--1537239
11
2.9
12
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13
52
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0
0
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0.92
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10.3
3
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0
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3
0
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1.09
1541057--1541102
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2.0
23
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0
6
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1.26
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2.1
18
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0
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27
21
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40
1.86
1541837--1541900
32
2.0
32
100
0
128
31
12
21
34
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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