Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  241  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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29
8
33
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
29
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189
31
22
25
19
1.98
79944201--79944483
88
3.2
87
88
4
435
31
22
24
21
1.98
79944072--79944345
132
2.1
130
87
4
390
31
23
25
19
1.98
79943985--79944439
218
2.1
216
84
2
590
31
23
25
20
1.98
79945588--79945627
9
4.2
9
87
12
62
82
0
2
15
0.77
79945586--79945627
20
2.1
19
91
8
66
80
0
2
16
0.81
79946297--79946322
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
79946373--79946401
12
2.4
12
100
0
58
34
6
0
58
1.25
79946364--79946406
21
2.0
21
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8
70
32
6
0
60
1.23
79946451--79946572
3
43.0
3
68
11
51
30
9
0
59
1.34
79946475--79946527
14
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14
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26
7
0
66
1.18
79946475--79946524
25
2.0
25
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26
6
0
68
1.13
79946474--79946652
45
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133
27
7
1
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1.32
79946620--79946650
15
2.1
15
93
0
53
29
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0
64
1.18
79946733--79946786
3
18.3
3
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3
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33
3
0
62
1.12
79953954--79953978
9
2.8
9
100
0
50
28
0
24
48
1.52
79961546--79961601
16
3.3
16
72
13
58
30
25
7
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79961536--79961607
35
2.1
35
97
0
135
33
22
6
37
1.81
79967296--79967333
12
3.3
12
78
14
53
71
2
10
15
1.25
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24
2.6
24
92
0
99
69
7
1
20
1.22
79967422--79967468
6
7.8
6
81
13
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70
4
0
25
1.05
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17
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16
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3
1
25
1.16
79968265--79968318
16
3.3
16
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5
72
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5
0
27
1.13
79974090--79974234
50
3.0
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2
175
28
20
24
26
1.99
79974101--79974234
48
2.7
50
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2
173
27
20
25
26
1.99
79977317--79977695
48
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26
16
28
28
1.97
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2.0
112
100
0
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1.76
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39
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39
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0
332
37
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26
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1.91
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19
1.9
19
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27
8
0
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1.21
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1.9
18
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0
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14
20
1.70
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48
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16
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28
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1.9
22
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2
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53
1.47
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40
4.6
40
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23
21
27
27
1.99
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2.3
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230
23
21
27
27
1.99
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40
4.6
40
83
6
205
23
21
27
27
1.99
80017548--80017728
80
2.3
81
84
9
230
23
21
27
27
1.99
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5.6
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232
30
28
14
26
1.95
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3.2
55
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0
255
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29
14
25
1.94
80051420--80051571
27
5.6
27
92
3
232
30
28
13
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80051420--80051596
55
3.2
55
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0
246
31
29
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26
1.93
80057568--80057772
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5.2
40
90
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305
24
22
27
25
2.00
80057564--80057772
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2.00
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19
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0
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238
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15
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1.92
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43
2.5
43
82
7
123
32
15
18
33
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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