Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  22  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6039741--6039795
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28
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5
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0
0
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2.7
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5
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20
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1.97
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2.3
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235
28
20
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26
1.99
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2.0
122
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2.0
46
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0
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37
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2.7
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3
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0
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1.11
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2.0
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2.0
23
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1.9
24
100
0
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32
17
4
45
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6080475--6080789
127
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125
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18
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132
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19
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3.7
132
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643
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19
23
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1.98
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184
28
19
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27
1.99
6088860--6089340
263
1.8
263
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4
585
28
20
23
27
1.99
6092097--6092260
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2.2
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175
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14
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2.0
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0
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21
2.0
22
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19
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6097012--6097053
11
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10
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57
28
4
47
19
1.69
6101091--6101165
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4.2
18
84
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11
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1.72
6102326--6102377
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2.5
20
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17
52
53
1
1
42
1.23
6104400--6104439
18
2.1
18
86
9
53
35
2
5
57
1.34
6104410--6104461
18
2.9
18
83
8
54
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3
3
57
1.35
6104418--6104483
34
1.9
33
82
17
82
34
4
6
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1.45
6116581--6116664
43
1.9
44
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2
134
33
27
19
20
1.96
6116845--6116932
43
2.0
44
88
2
133
26
22
25
26
2.00
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42
2.1
42
91
0
138
29
18
24
27
1.98
6119183--6119222
18
2.1
18
86
9
53
35
2
5
57
1.34
6119193--6119244
18
2.9
18
83
8
54
34
3
3
57
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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0
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1.42
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394
2.0
394
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0
1512
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27
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2.0
16
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0
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0
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2.2
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1
19
29
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31
2.2
34
80
16
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52
1
18
28
1.54
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3.0
14
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2
0
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0
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2
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1.20
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22
103
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2
5
61
1.32
6130266--6130386
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2.6
46
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18
117
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2
4
60
1.31
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23
5.7
22
78
20
119
34
2
5
58
1.33
6130285--6130404
46
2.6
48
81
15
137
33
2
5
59
1.33
6131587--6131639
21
2.5
22
78
3
63
54
9
5
30
1.55
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20
2.1
22
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8
58
33
2
4
60
1.29
6133108--6133177
22
3.2
22
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13
63
34
1
5
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1.31
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3.1
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31
2
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57
1.40
6135512--6135557
15
3.2
15
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1.75
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20
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206
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20
18
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2.5
54
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245
8
25
19
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1.79
6152574--6152654
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2.1
39
100
0
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14
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1.86
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18
2.4
18
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7
61
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6181588--6181636
24
2.0
24
85
14
66
46
0
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51
1.12
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0
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14
14
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1.87
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11
52
26
0
8
64
1.22
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13
2.4
14
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0
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1.24
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26
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0
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0
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16
2.1
16
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0
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50
14
17
17
1.79
6200504--6200560
28
2.0
28
93
0
96
19
17
19
43
1.88
6202776--6202816
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
6209708--6210013
134
2.3
134
88
1
443
28
20
21
29
1.98
6210026--6210813
84
9.4
83
90
2
1182
35
22
23
18
1.95
6210076--6210466
40
9.4
40
64
20
149
36
23
22
17
1.95
6211248--6211274
5
5.4
5
100
0
54
18
0
0
81
0.69
6213062--6213121
3
20.3
3
82
3
68
60
1
6
31
1.33
6213340--6213399
3
19.7
3
93
3
102
66
1
1
30
1.11
6215324--6215742
44
9.6
44
68
11
245
19
24
21
35
1.96
6215281--6215778
87
5.7
87
91
1
793
19
23
21
35
1.96
6215275--6215798
43
12.1
42
67
13
242
20
23
21
34
1.96
6224836--6224895
3
19.7
3
96
3
111
66
0
1
31
1.01
6234085--6234137
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
6235618--6235682
32
2.0
32
96
0
121
38
23
6
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6238731--6238860
27
4.8
27
89
0
161
29
22
7
40
1.81
6238731--6238889
54
2.9
54
81
0
174
31
22
7
38
1.82
6238785--6239061
27
10.2
27
79
9
161
39
20
6
33
1.79
6238785--6239050
54
4.9
54
79
5
234
39
20
6
33
1.78
6238853--6239005
53
2.9
54
86
3
202
44
22
5
28
1.74
6240205--6240252
25
1.9
25
82
0
60
33
22
16
27
1.96
6240291--6240347
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
6240289--6240359
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
6240300--6240354
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
6240406--6240610
25
8.2
25
90
5
301
29
18
23
28
1.98
6240796--6240859
31
2.1
31
90
0
101
39
15
23
21
1.92
6246379--6246447
3
22.7
3
72
19
54
31
2
0
65
1.08
6246379--6246489
17
6.2
17
72
18
66
32
2
0
63
1.14
6246388--6246450
11
5.6
11
76
16
58
31
3
0
65
1.09
6246322--6246486
72
2.3
71
81
9
178
30
4
1
63
1.24
6250675--6250711
15
2.5
16
87
12
53
21
24
10
43
1.84
6258819--6259295
206
2.3
206
97
0
882
32
18
20
27
1.97
6261071--6261125
11
4.9
11
75
18
51
30
3
0
65
1.10
6263148--6263188
21
2.0
21
100
0
82
51
9
4
34
1.56
6266764--6266824
22
2.7
21
80
12
59
29
9
0
60
1.29
6266795--6266829
15
2.3
15
95
0
61
34
8
0
57
1.29
6266795--6266827
12
2.8
12
95
0
57
33
9
0
57
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6266795--6266841
15
3.1
15
90
0
58
34
10
0
55
1.35
6277661--6277816
82
1.9
81
85
3
215
26
16
28
28
1.97
6277660--6277813
55
2.9
52
82
7
175
27
16
27
27
1.97
6277661--6277816
27
5.7
27
81
6
163
26
16
28
28
1.97
6277653--6277837
27
6.8
27
75
9
101
26
16
28
29
1.97
6277653--6277837
82
2.3
81
78
2
210
26
16
28
29
1.97
6282664--6282910
46
5.7
46
69
17
170
32
20
19
27
1.97
6282877--6282960
44
1.9
44
90
0
132
29
21
25
23
1.99
6282877--6282993
44
2.7
44
81
6
130
29
23
23
24
1.99
6282714--6283114
218
1.9
214
80
6
452
31
20
21
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349