Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  54  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15618919--15618949
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16
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2.6
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0
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2
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1.66
15619567--15619706
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2
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20
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1.80
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2.8
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26
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2
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23
23
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35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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19
14
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15632394--15632497
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19
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175
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2.1
22
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3.0
54
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1.98
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2.5
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57
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2.2
20
87
4
61
62
4
9
23
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1.91
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0
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2.0
29
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25
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5
47
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
15762054--15762180
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2
0
66
1.03
15772642--15772709
20
3.5
20
71
15
70
35
13
14
36
1.85
15772637--15772716
38
2.1
38
100
0
160
36
12
12
38
1.81
15775516--15775557
18
2.4
17
88
4
57
76
0
7
16
1.00
15786592--15786629
17
2.3
17
86
13
53
5
7
31
55
1.51
15791887--15791935
25
1.9
26
91
4
82
30
28
8
32
1.86
15792746--15792781
11
3.2
11
88
7
54
80
19
0
0
0.71
15795201--15795246
18
2.5
18
86
10
58
15
6
0
78
0.95
15795207--15795261
18
3.2
18
83
16
57
20
5
0
74
1.01
15796860--15796899
20
2.0
20
90
9
64
20
7
2
70
1.24
15804033--15804072
14
2.9
14
88
11
64
17
2
0
80
0.83
15809313--15809359
22
2.1
22
100
0
94
55
0
4
40
1.19
15821713--15821887
43
4.1
43
76
11
148
27
20
25
26
1.99
15821713--15821887
85
2.0
87
83
6
223
27
20
25
26
1.99
15821770--15821887
42
2.8
42
75
10
132
27
20
25
27
1.99
15825303--15825510
56
3.7
56
90
0
326
26
17
23
32
1.96
15831581--15832169
149
3.9
151
86
6
760
41
5
10
42
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15831631--15831834
51
4.1
49
67
16
123
39
4
10
45
1.58
15832163--15832208
21
2.1
23
84
8
60
45
8
13
32
1.73
15833984--15834048
13
5.5
13
70
20
61
50
12
0
36
1.40
15833985--15834048
23
2.8
23
90
0
101
51
10
0
37
1.37
15845056--15845103
17
3.0
17
82
8
57
39
4
6
50
1.47
15845835--15845879
21
2.2
21
84
4
56
64
6
0
28
1.19
15846662--15846708
21
2.3
20
81
3
58
17
6
31
44
1.73
15847739--15847777
14
2.8
14
84
0
51
76
0
12
10
1.01
15847788--15847873
3
28.7
3
100
0
172
66
0
33
0
0.92
15851211--15851263
6
8.8
6
93
0
52
58
0
39
1
1.09
15851211--15851278
18
3.8
18
86
1
75
52
0
44
2
1.16
15851230--15851297
6
11.8
6
89
6
79
47
0
51
1
1.09
15851633--15851676
20
2.4
18
82
14
54
2
25
2
70
1.10
15858456--15858548
30
3.1
30
86
6
118
31
13
18
36
1.90
15858551--15858640
30
3.0
31
79
11
105
30
17
17
34
1.94
15858482--15858622
74
1.9
74
82
2
176
32
15
16
35
1.90
15859032--15859072
18
2.3
18
91
0
64
34
12
12
41
1.80
15859447--15859487
19
2.1
20
90
4
66
48
2
2
46
1.28
15860001--15860148
71
2.1
70
89
2
226
52
4
12
30
1.60
15868494--15868527
16
2.1
17
88
5
52
29
0
2
67
1.05
15871715--15871809
45
2.1
45
98
0
181
21
15
15
47
1.82
15877226--15877282
25
2.3
24
76
5
60
17
29
17
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15887924--15887950
14
1.9
14
100
0
54
7
0
44
48
1.31
15888008--15888146
34
4.2
32
74
8
109
43
0
12
42
1.48
15895618--15895658
21
2.0
21
90
0
64
24
19
29
26
1.98
15896455--15896486
3
10.7
3
100
0
64
0
34
0
65
0.93
15896540--15896580
21
2.0
21
90
0
64
26
29
19
24
1.98
15896611--15896683
31
2.4
31
81
6
87
23
10
20
45
1.83
15900649--15900695
17
2.9
15
82
14
58
74
4
19
2
1.09
15900657--15900692
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2.2
16
90
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2
16
2
1.00
15906752--15906815
25
2.6
25
76
0
74
31
17
32
18
1.94
15908950--15909051
49
2.1
49
90
0
159
26
26
4
42
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349