Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.1
60
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32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.21
1775032--1775085
23
2.5
22
75
13
60
57
5
5
31
1.45
1775048--1775133
25
3.7
24
79
10
81
55
5
6
31
1.50
1775158--1775288
47
2.9
45
73
15
117
58
2
3
35
1.29
1775158--1775213
11
4.8
11
77
16
51
60
0
3
35
1.14
1775770--1775884
30
3.8
30
94
0
203
20
3
49
26
1.65
1776582--1776832
77
3.3
77
89
2
366
35
21
17
25
1.95
1776904--1776954
14
3.6
14
77
12
50
64
1
11
21
1.36
1776907--1776940
16
2.1
16
94
0
59
70
0
8
20
1.13
1776934--1777175
76
3.2
75
85
3
317
33
21
16
28
1.95
1777165--1777192
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
1777084--1777268
89
2.1
88
84
7
248
37
19
17
25
1.93
1777174--1777342
73
2.3
74
85
2
232
36
19
17
26
1.94
1777322--1777371
14
3.6
14
81
7
57
64
4
12
20
1.43
1777333--1777373
15
2.8
15
78
14
50
65
4
14
14
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1777351--1777522
78
2.2
75
84
6
218
38
19
16
26
1.92
1777166--1777522
183
2.0
177
90
4
554
38
19
16
25
1.92
1777044--1777661
345
1.8
337
83
7
825
35
19
16
28
1.94
1777527--1777662
71
1.9
71
93
0
236
30
18
16
34
1.93
1777821--1778153
74
4.4
74
85
4
391
31
21
15
32
1.94
1777933--1778167
72
3.2
72
88
3
337
34
18
15
31
1.92
1777821--1778167
146
2.3
147
81
6
403
33
20
14
31
1.93
1778171--1778345
70
2.5
70
84
4
203
33
22
15
28
1.94
1789557--1789632
29
2.5
30
82
4
82
39
6
19
34
1.78
1790713--1790852
32
4.6
30
70
18
92
50
10
15
25
1.74
1794278--1794336
29
2.0
29
83
6
75
50
3
13
32
1.58
1796004--1796034
14
2.2
14
94
0
53
3
12
0
83
0.75
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4
10.8
4
100
0
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51
23
0
25
1.49
1802526--1802563
3
12.7
3
94
0
67
28
0
34
36
1.58
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17
2.3
17
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4
60
26
0
0
73
0.83
1816000--1816037
8
4.8
8
84
12
51
26
0
0
73
0.83
1816455--1816515
31
2.0
31
90
0
95
50
11
16
21
1.76
1816662--1816690
8
3.6
8
100
0
58
0
10
0
89
0.48
1817958--1817991
17
1.9
18
94
5
61
58
8
0
32
1.29
1821218--1821251
11
3.2
11
87
8
52
26
0
0
73
0.83
1822031--1822091
24
2.5
25
78
10
72
29
1
0
68
0.99
1822749--1822774
6
4.3
6
100
0
52
84
0
0
15
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1822984--1823031
23
2.1
23
84
7
62
54
0
0
45
0.99
1824697--1824743
22
2.1
22
100
0
94
21
19
23
36
1.95
1824711--1824872
81
2.0
81
98
0
315
29
17
22
30
1.97
1832508--1832583
37
2.1
37
94
0
134
32
14
10
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1.80
1840453--1840487
18
1.9
18
88
0
52
60
0
11
28
1.32
1841699--1841737
19
2.0
20
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0
0
53
1.00
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2.6
29
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13
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13
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35
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2.1
56
89
0
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2.7
24
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7
65
41
0
1
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1.09
1858338--1858376
15
2.4
16
87
8
53
35
0
0
64
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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