Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5527854--5527975
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2.0
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3.5
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3
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152
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1485
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2.2
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1.97
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4.0
214
84
8
1129
32
18
24
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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370
2.0
368
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1.97
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442
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18
23
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1.97
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122
2.0
121
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375
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17
26
25
1.98
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2.0
197
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1.98
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3.0
76
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1
377
31
18
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24
1.97
5568560--5569052
274
1.8
272
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0
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0
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2.1
19
90
0
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60
0
5
35
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.1
16
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50
50
14
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1.79
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2.0
130
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2.0
20
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66
0
2
30
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5640126--5640173
21
2.3
21
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4
0
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5640129--5640171
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0
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2.0
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0
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31
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0
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197
30
24
14
30
1.95
5664809--5665081
69
3.9
70
79
1
271
30
24
15
30
1.95
5664809--5665081
104
2.6
104
78
5
289
30
24
15
30
1.95
5669734--5669758
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
5672708--5672745
17
2.2
17
90
0
58
47
0
0
52
1.00
5672708--5672746
18
2.2
17
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4
51
48
0
0
51
1.00
5682375--5682399
10
2.5
10
100
0
50
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0
0
48
1.00
5686334--5686388
17
3.2
18
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7
87
49
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10
30
1.69
5686917--5686970
26
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27
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5
24
1.36
5686979--5687031
18
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17
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19
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0
0
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1.00
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2.5
22
73
15
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51
1
6
39
1.39
5692844--5692908
26
2.4
28
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7
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0
9
41
1.35
5692976--5693018
3
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2
0
32
1.06
5692962--5693008
23
2.2
22
85
11
62
65
4
0
29
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5692974--5693018
23
2.0
23
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0
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2
0
33
1.06
5692979--5693018
20
2.0
20
95
0
71
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2
0
32
1.06
5694638--5695672
44
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43
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13
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27
22
19
30
1.98
5694626--5694787
87
1.9
87
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2
209
25
24
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29
1.99
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2.0
15
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0
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1.35
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2
0
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18
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1.9
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21
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1.94
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10
5.6
10
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1
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1.21
5715858--5715913
20
2.8
19
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10
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67
1
5
25
1.21
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30
1.9
30
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13
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1
5
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1.19
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24
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5
15.6
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16
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0
3
21
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5717860--5717942
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24
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0
3
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4.5
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0
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1.9
32
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24
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2.0
47
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29
22
21
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2.2
31
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0
84
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20
26
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33
2.2
33
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0
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10
3.8
10
83
13
51
65
2
7
23
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5725088--5725113
10
2.6
10
100
0
52
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0
7
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1.14
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2.3
18
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4
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37
17
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25
1.94
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21
2.3
22
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6
57
28
6
2
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1.28
5739000--5739048
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21
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2
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2.2
31
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0
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28
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17
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0
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0
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1.9
13
100
0
50
60
16
8
16
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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