Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  43  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12099101--12099185
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19
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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59
1.21
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1.21
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59
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
12219753--12219793
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21
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19
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21
29
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183
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48
0
51
1.00
12277508--12277535
3
9.3
3
100
0
56
67
0
32
0
0.91
12287946--12287994
20
2.4
21
80
13
57
46
0
0
53
1.00
12292454--12292503
19
2.6
19
76
17
59
38
0
2
60
1.09
12295506--12295736
115
2.0
115
96
0
426
38
19
8
34
1.82
12302296--12302473
35
5.1
35
87
2
250
30
12
25
31
1.93
12303671--12303725
27
2.0
27
92
0
92
27
45
21
5
1.74
12308134--12308238
44
2.3
44
86
3
138
29
22
14
33
1.94
12315506--12315613
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
12323842--12323906
32
2.1
32
85
8
89
1
18
3
76
0.99
12323845--12323917
21
3.4
22
76
14
80
1
16
2
79
0.92
12328576--12328605
8
3.8
8
95
0
51
46
23
0
30
1.52
12329567--12329645
25
3.2
25
77
8
72
36
22
20
20
1.95
12333679--12333707
9
3.2
9
100
0
58
44
10
0
44
1.38
12339807--12340056
52
4.9
52
90
3
368
35
14
22
27
1.93
12339963--12340178
37
5.3
44
86
9
190
37
14
22
26
1.92
12340031--12340176
37
4.0
37
91
1
233
36
15
22
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12349611--12349691
39
2.2
38
82
6
94
32
3
1
62
1.20
12350435--12350484
18
2.8
18
80
14
68
30
14
6
50
1.66
12353133--12353307
52
3.1
58
77
16
208
43
6
20
30
1.76
12353290--12353327
13
3.0
13
96
3
69
68
0
15
15
1.22
12353157--12353327
51
3.2
52
74
15
145
45
5
19
29
1.73
12353290--12353327
6
6.2
6
93
6
67
68
0
15
15
1.22
12355864--12355935
21
3.4
21
74
11
74
23
27
31
16
1.96
12359927--12360197
46
5.8
48
75
13
192
29
18
28
23
1.98
12359969--12360197
46
4.9
47
78
10
202
29
18
29
22
1.98
12359973--12360194
47
4.7
47
77
12
174
28
18
29
22
1.98
12359932--12360197
140
1.9
141
81
8
328
29
18
28
23
1.98
12366600--12366826
47
4.8
47
81
11
202
27
18
30
22
1.98
12366563--12366825
140
1.9
141
82
10
333
28
18
29
23
1.98
12373256--12373286
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
12373253--12373292
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
12373476--12373620
53
2.9
48
79
10
141
20
23
19
36
1.95
12373524--12373727
55
3.8
54
80
5
223
21
25
17
36
1.94
12380833--12380863
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
12380830--12380869
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
12381065--12381310
55
4.6
54
76
9
204
22
24
16
36
1.94
12388905--12388937
14
2.4
14
100
0
66
36
12
0
51
1.39
12394652--12394679
13
2.2
13
100
0
56
50
21
0
28
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12396091--12396137
4
11.8
4
77
8
51
0
23
2
74
0.93
12398511--12398552
21
2.0
21
100
0
84
47
9
19
23
1.78
12401238--12401361
23
5.4
23
76
3
117
24
22
20
32
1.98
12401230--12401347
46
2.6
45
90
1
182
22
23
20
33
1.97
12401230--12401362
45
2.9
45
88
3
187
23
22
20
33
1.97
12412327--12412435
58
1.9
56
81
3
128
36
12
7
43
1.71
12415056--12415644
150
3.9
149
89
2
844
22
25
19
32
1.97
12417872--12417945
36
2.1
36
97
0
139
48
13
10
27
1.75
12420246--12420279
3
11.3
3
87
0
50
29
29
0
41
1.57
12420252--12420282
15
2.1
15
100
0
62
32
25
0
41
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349