Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16609009--16609053
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22
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0
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18
21
22
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16610805--16611478
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2.0
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2.0
22
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2
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69
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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1
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1.36
16642136--16642205
3
23.3
3
74
11
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61
5
1
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1.28
16643172--16643196
8
3.1
8
100
0
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24
12
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17
30
1.97
16643668--16644340
316
2.1
317
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1
1271
27
23
18
30
1.97
16643926--16644123
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2.0
98
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21
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1.96
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20
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1.98
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2.0
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1.98
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29
1.98
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1.98
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2.0
229
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86
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23
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2.5
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8
100
0
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12
52
12
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.64
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3.2
18
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52
9
12
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1.95
16682196--16682326
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147
25
28
15
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16682447--16683026
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7.4
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1
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23
18
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1.97
16682367--16683026
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4.3
156
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1
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25
24
18
32
1.97
16682352--16683026
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2.9
232
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956
25
23
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32
1.97
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13
10
42
1.78
16695170--16695223
17
2.9
18
89
10
83
35
12
11
40
1.79
16698240--16698285
24
1.9
24
100
0
92
32
4
15
47
1.65
16699810--16699857
7
6.9
7
86
9
71
68
0
2
29
1.01
16708237--16708464
49
4.7
49
84
5
252
25
29
18
26
1.98
16708286--16708464
99
1.8
96
85
5
252
24
29
18
28
1.98
16709326--16709356
13
2.4
13
100
0
62
58
22
6
12
1.58
16714727--16714866
33
4.3
32
83
7
149
39
10
21
29
1.86
16714823--16714942
33
3.7
32
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3
123
35
14
21
29
1.93
16714882--16714965
33
2.5
33
84
0
105
34
15
25
25
1.95
16730185--16730382
98
2.0
98
95
0
351
28
8
19
43
1.80
16732296--16732393
19
5.2
19
92
7
164
37
10
16
35
1.82
16732286--16732393
36
2.9
35
78
20
112
37
10
15
36
1.82
16738051--16738120
7
9.7
7
78
18
65
82
0
12
4
0.80
16738049--16738106
20
2.7
21
89
10
91
86
0
10
3
0.69
16738050--16738106
9
6.6
8
82
11
51
85
0
10
3
0.70
16738051--16738120
21
3.2
21
90
8
97
82
0
12
4
0.80
16738095--16738126
14
2.2
15
94
5
57
71
0
21
6
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16738973--16739466
44
11.2
44
73
10
346
31
17
24
27
1.97
16739096--16739451
132
2.7
132
94
0
622
32
16
24
26
1.96
16738972--16739327
175
2.0
175
89
2
554
31
17
23
27
1.97
16739413--16740146
206
3.6
206
93
0
1202
30
17
21
29
1.97
16740543--16740640
19
5.2
19
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7
146
37
10
16
35
1.82
16740533--16740618
36
2.4
35
83
14
106
37
10
16
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1.83
16740549--16740640
36
2.4
37
91
7
141
38
10
15
35
1.82
16741149--16741196
26
2.0
24
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12
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20
6
8
64
1.43
16747206--16747243
19
2.0
19
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10
51
65
5
0
28
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17
3.4
17
70
15
60
55
5
14
24
1.61
16751795--16751857
31
2.0
31
100
0
126
61
3
12
22
1.45
16756317--16756358
22
1.9
22
85
0
57
73
0
11
14
1.09
16757113--16757157
22
2.1
21
87
4
63
71
4
2
22
1.15
16762611--16762643
16
2.1
16
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5
50
27
0
3
69
1.03
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15
2.3
17
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51
16
10
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64
1.47
16772259--16772326
29
2.4
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14
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32
13
4
50
1.61
16777710--16777745
12
3.0
12
91
0
54
19
55
25
0
1.43
16778105--16778144
20
2.0
20
90
0
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20
0
7
72
1.08
16778125--16778170
25
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23
86
8
65
28
0
8
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1.24
16778655--16778687
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
16778734--16778792
21
2.8
22
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7
70
25
0
5
69
1.09
16778763--16778822
26
2.4
25
86
10
88
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16779490--16779523
18
1.9
17
88
5
50
85
5
2
5
0.83
16780698--16780763
23
2.9
23
93
4
107
48
39
4
7
1.52
16781769--16781801
17
1.9
18
88
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52
6
12
9
72
1.26
16781774--16781829
25
2.2
25
81
12
62
14
7
8
69
1.35
16791879--16791967
6
15.7
6
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3
143
35
0
11
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1.37
16792280--16792349
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2.5
28
78
15
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38
1
18
41
1.60
16794883--16794967
42
2.0
42
90
0
134
36
10
21
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1.84
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9
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25
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1.96
16805956--16806049
40
2.4
39
84
5
118
37
39
10
12
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349