Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  255  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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Percent
Indels
Score
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1.99
84939031--84939214
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4.6
40
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216
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22
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29
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1.97
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1.97
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19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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29
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28
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371
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8
19
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84978109--84978471
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13.5
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6
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16
16
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16
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22
2.9
22
77
9
67
35
21
21
20
1.96
84981481--84982122
27
23.8
27
85
2
788
24
21
17
36
1.95
84982168--84982535
81
4.5
82
84
6
360
31
9
19
39
1.83
84982168--84982535
27
13.7
27
84
3
307
31
9
19
39
1.83
84988889--84989200
47
6.7
46
73
10
226
21
28
21
27
1.99
84988889--84989200
140
2.2
138
82
7
353
21
28
21
27
1.99
84988992--84989203
94
2.3
92
87
4
291
21
29
21
27
1.98
84989313--84989344
17
2.0
17
88
11
50
46
18
3
31
1.65
84992915--84992974
30
2.0
30
87
6
86
38
8
26
26
1.85
84998590--84998622
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
85002907--85003022
37
3.1
37
94
0
196
25
32
18
22
1.97
85003141--85003391
47
5.3
47
92
1
403
27
30
9
32
1.88
85006761--85006983
80
2.8
80
84
2
234
25
27
22
24
2.00
85006761--85006983
120
1.9
120
81
5
272
25
27
22
24
2.00
85006761--85006945
40
4.6
40
89
2
246
25
27
21
25
2.00
85007293--85007371
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
85007353--85007455
43
2.4
43
100
0
206
26
35
15
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85013383--85013647
27
9.8
27
80
9
299
26
20
10
43
1.83
85013376--85013642
54
4.9
54
87
2
369
27
20
9
42
1.83
85013383--85013647
81
3.3
81
83
5
347
26
20
10
43
1.83
85013652--85013866
27
8.0
27
85
2
254
35
18
19
26
1.95
85014073--85014155
27
3.1
26
87
5
112
19
21
21
37
1.94
85014243--85014301
22
2.7
22
81
0
64
20
25
22
32
1.98
85014466--85014539
27
2.8
27
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6
80
18
24
20
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1.95
85014657--85014758
6
16.8
6
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17
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19
17
13
49
1.80
85014657--85014758
30
3.4
30
85
6
143
19
17
13
49
1.80
85020241--85020355
50
2.4
49
84
5
146
26
22
14
35
1.93
85023905--85024109
40
5.2
40
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0
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22
23
26
26
2.00
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3.7
14
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7
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6
30
0
64
1.18
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11.2
6
81
6
53
14
7
1
76
1.07
85030356--85030413
17
3.4
17
76
6
55
13
6
1
77
1.05
85030356--85030419
11
5.6
11
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18
60
14
7
1
76
1.07
85030383--85030419
17
2.2
17
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0
56
13
2
2
81
0.92
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2.0
33
100
0
132
36
21
15
27
1.93
85044376--85044462
44
2.0
44
90
4
140
31
6
19
42
1.77
85046271--85046601
48
6.9
48
78
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294
28
16
28
25
1.97
85046271--85046538
144
1.9
144
84
3
369
29
15
28
26
1.96
85046275--85046601
144
2.3
144
80
4
356
28
17
28
25
1.97
85048138--85048214
26
3.0
26
86
0
109
40
22
18
19
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85048802--85048856
27
2.0
27
85
0
74
25
23
16
34
1.95
85055587--85055658
26
2.8
26
84
0
81
40
23
18
18
1.91
85065403--85065518
50
2.4
47
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5
144
27
22
14
35
1.93
85069739--85069860
46
2.6
47
84
5
147
26
22
14
36
1.93
85077492--85077680
78
2.4
80
83
5
233
26
29
21
22
1.99
85077476--85077680
39
5.2
39
83
5
200
26
29
21
22
1.99
85084970--85085047
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1.9
40
82
7
95
37
30
11
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337
26
27
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23
1.99
85088599--85088854
78
3.2
80
88
7
344
26
27
21
23
1.99
85095713--85095847
41
3.3
40
75
7
119
33
26
14
25
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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