Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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2.2
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10
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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21
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5
57
38
2
6
54
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12602443--12602493
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4.1
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0
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2.5
22
73
2
58
45
1
5
47
1.36
12610105--12610164
29
2.0
31
83
6
79
51
8
11
28
1.67
12610197--12610230
18
1.9
17
88
5
50
20
2
8
67
1.31
12611318--12611360
11
4.3
10
78
21
54
27
0
2
69
1.00
12614865--12614895
15
2.1
15
93
0
53
9
35
0
54
1.33
12618903--12618934
4
7.8
4
93
6
55
28
0
21
50
1.49
12632079--12632110
1
32.0
1
100
0
64
100
0
0
0
0.00
12633315--12633569
86
2.9
88
84
4
313
30
23
22
23
1.99
12633324--12633623
86
3.5
84
81
7
300
30
23
22
23
1.99
12633705--12633959
46
5.8
46
74
10
201
29
20
23
27
1.98
12633662--12633999
41
7.8
44
73
10
194
30
19
22
27
1.98
12633667--12634004
87
3.9
87
74
9
292
29
19
22
27
1.98
12633751--12634003
130
2.0
128
81
7
298
28
19
24
27
1.98
12633583--12633999
174
2.4
174
87
4
569
30
19
22
27
1.98
12633583--12634048
174
2.7
173
84
5
500
30
19
22
27
1.98
12634291--12634323
15
2.2
15
89
10
50
42
45
6
6
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12642143--12642237
25
3.8
25
92
0
154
32
18
23
25
1.97
12642143--12642261
25
4.7
25
86
2
121
30
20
24
25
1.99
12644625--12644700
38
2.0
38
94
0
134
26
26
13
34
1.93
12657798--12657851
21
2.5
22
72
6
56
48
0
5
46
1.25
12662866--12662924
29
2.0
29
83
9
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54
15
3
27
1.57
12667532--12667590
24
2.5
22
77
17
66
55
5
6
32
1.48
12667529--12667651
23
4.8
24
68
22
65
57
2
8
31
1.41
12668077--12668163
3
30.3
3
72
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64
2
4
28
1.26
12676103--12676174
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2.2
34
85
9
96
38
4
9
47
1.56
12676116--12676191
17
4.3
18
70
11
68
40
5
6
47
1.52
12677565--12677623
29
1.9
30
83
13
75
54
10
8
27
1.63
12681220--12681258
19
2.1
19
90
0
60
48
0
2
48
1.15
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20
2.7
20
83
13
67
51
0
0
48
1.00
12696340--12696379
11
3.6
11
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0
62
22
17
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55
1.61
12696603--12696635
11
2.9
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13
52
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0
0
33
0.92
12700252--12700797
126
4.3
126
88
2
774
34
17
20
27
1.96
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30
2.2
30
81
10
73
7
19
43
28
1.78
12704285--12704320
15
2.5
15
90
4
56
66
0
5
27
1.13
12704333--12704381
22
2.2
21
78
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53
44
2
24
28
1.65
12704347--12704389
11
3.9
11
90
0
68
44
0
27
27
1.55
12712628--12712709
40
2.1
39
97
2
155
37
17
7
37
1.77
12715033--12715178
73
2.0
73
90
0
229
30
13
13
43
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12716880--12716945
33
2.0
33
91
5
107
30
37
9
22
1.85
12723351--12723384
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
12727989--12728022
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
12729109--12729162
28
2.0
28
81
3
65
40
0
37
22
1.54
12732938--12732999
24
2.6
24
78
12
74
54
1
0
43
1.09
12736846--12736896
25
2.1
24
82
7
59
64
9
1
23
1.34
12736950--12737013
30
2.1
30
85
8
85
57
9
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28
1.50
12737043--12737085
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2.0
22
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0
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0
55
56
9
14
19
1.66
12738245--12738288
19
2.3
20
76
11
56
38
4
2
54
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349